基于叶绿体全基因组的贝母属特异性DNA条形码的筛选.PDF

2016　第十八卷　第一期　★Vol.18 No.1 基于叶绿体全基因组的贝母属特异性 DNA 条形码的筛选＊ 1 1 1 1 2 1 ＊＊ 李 滢 ，姚 辉 ，宋经元 ，任风鸣 ，李西文 ，孙 超 （1. 中国医学科学院 北京协和医学院 药用植物研究所 北京 100193； 2. 中国中医科学院中药研究所 北京 100700） 摘 要：本研究通过对贝母属4 个物种叶绿体基因组进行全局分析，分别查找基因区域和基因间区的 高变异区域，筛选用于高效鉴别贝母属植物的新DNA 条形码序列。相关研究发现贝母属植物的基因区域 序列相似度极高，不适用于DNA 条形码鉴定研究；共有7 个基因间区可以作为潜在的贝母属植物鉴定的特 异性DNA 条形码。本研究所构建的DNA 条形码筛选方法，为筛选用于难鉴定科属的新的DNA 条形码提 供了通用的方法体系。 关键词 ：贝母属 叶绿体基因组 DNA 条形码 分子鉴定 doi ：10.11842/wst.2016.01.004　　中图分类号：R931.5　　文献标识码：A 贝母属Fritillaria 是百合科Liliaceae 中的一 明，贝母属植物可能是处于激烈分化的物种形成阶 ＊＊＊ 个大属，据电子植物志 记载，贝母属共有约 130 段，部分物种的分类存在很多争议，同一物种在不 个物种，主要分布在亚洲和地中海等北半球温带 同地区因植物形态和花部特征出现差异，而被划分 [2,3] 地区。中国有贝母属植物24 种及其4 个变种，其 为不同物种 。由于贝母属植物的这些特性，其形 中15 个种为中国的特有物种。贝母属药材以干 态学鉴定和现有分子鉴定都存在一定的困难。另 燥鳞茎入药，具有“清热润肺、化痰止咳”的功效， 外，由于贝母属药材市场需求量大，川贝母的价格 [1] 药用历史悠久 。2010 版《中国药典》收录的贝 昂贵等原因，贝母属药材的使用长期存在混伪品滥 母属药材包括川贝母、平贝母、浙贝母、伊贝母、湖 用的情况，这直接影响了贝母属植物临床用药的安 [1] 北贝母 。贝母是典型的多基源药材，以川贝母 全和疗效。因此，开展贝母属药材的鉴定研究，筛 FRITILLARIAE CIRRHOSAE BULBUS 为例，药典 选高效鉴定贝母属植物的DNA 条形码序列，对于 共收录的6 个物种分别为川贝母F. cirrhosa ，暗紫 贝母属药材的临床用药、质量控制以及合理开发利 贝母F. unibracteata ，甘肃贝母F. przewalskii ，梭砂 用具有重要意义。 贝母F. delavayi ，太白贝母F. taipaiensis ，和瓦布贝 DNA 条形码（DNA Barcode ）是指生物体内能 母F. unibracteata var. wabuensis 。据统计，《中国 够代表该物种的、标准的、有足够变异的、易扩增且 [4-6] 药典》涉及贝母属物种共 11 个。目前，已有研究表 相对较短的DNA 片段 。目前，公认较为高效的 植物DNA 条形码序列包括核基因组的ITS 和ITS2