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[临床医学]基因组测序和疾病变异检测
基因组测序和疾病变异检测
大纲
遗传疾病基因组研究概况
SNV和indel研究的意义
SNV和indel检测上机
2
理论
研究概况
基本概念
全基因组测序
外显子捕获
软件比较
3
人类疾病分类
其它 癌症 心血管疾病 精神障碍类疾病
15%
19%
51%
15%
4
遗传疾病分类
染色体
病或染
色体综
合征
单基因 遗传类 多基因
病 疾病 病
癌症
5
遗传疾病基因组研究手段
疾病类型 测序手段 检测变异类型
单基因病 高层数外显子捕获 SNV ,小indel
全基因组测序(高,低层数),高层数
多基因病 CNV,SV ,SNV ,小indel
外显子捕获
全基因组测序(高,低层数),高层数
癌症 CNV,SV ,SNV ,小indel
外显子捕获
染色体病 低层数大插入片段全基因组测序 染色体拷贝
6
通过SNV和indel研究发现膀胱癌和染色质重塑密切相关
7
通过SNV和indel研究发现肾癌和泛素介导的蛋白降解通路(UMPP)密切相关
8
已经找到的一些癌症药靶基因
9
中心法则
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