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精准医疗简介
精准医疗简介
作者:医学界智库
什么是精准医疗?
精准医疗(Precision Medicine )是近几年兴起的疾病治疗方案,它强调在治疗时考
虑个人的基因变化,环境影响,生活方式等。基于患者的遗传信息的诊断测试结合其他分
子或细胞的分析结果,再针对性地选择适当和最佳疗法。支持技术包括分子诊断,成像和
分析软件。
从个性化治疗到精准治疗
21 世纪初人类基因组计划完成时提出了个性化治疗(Personalized Medicine )这个
理念,主要旨在希望用测序得到的遗传标记来判断病人是否对药物有应答,以便针对每个
病人进行治疗,然而,疾病往往是多基因的,很难从一个简单的角度判断。2011 年,美
国国家科学院的研究人员出版了一本题为“走向精密医学:建立和知识网络的生物医学研
究疾病的新分类”的报告,首次提出精准医疗的概念,提出“新分类学”,将在传统的疾
病症候之外通过潜在的分子以及其他因素来区分疾病,并提出建立新的数据网络,将治疗
过程中的患者临床数据和生物医学研究结合起来。【1】
据美国国家研究委员会的一份报告,“精密医学指根据每个患者的个体特征定制医
疗,并不是像字面上意味着为每个病人创建特有的药物或医疗设备,而是指将患者根据对
疾病的易感性,疾病的生物机制和预后,对治疗的反应等等分类成不同亚群。这样再针对性
地进行预防或治疗,减少费用和副作用。尽管术语“个性化医学”也用于传达这个意思,
但有时被误解为暗示独特的治疗可以被设计为每个病人单独的【2】从制药行业(比如著
名制药公司辉瑞的网页)来看,这两个词有着不同的定义,概括来说,精准治疗这个概念
比个性化治疗更为广泛和全面。
这几年得益于大规模生物数据库的建立(比如人类基因组测序),高通量组学的发展
(如蛋白组学,代谢组学等),以及各种检测手段的兴起,还有计算和分析大规模数据的
发展,精准治疗飞速发展。目前精准医疗的主要进展集中在癌症治疗领域(病人存活率得
到了显著提升)。
癌症的精准治疗理念
癌症的本质是多基因的遗传疾病,随着肿瘤发展,癌症细胞仍然在不断地进行分裂和
增殖积累突变,有高度的异质性,其基因组具有不稳定性。近年来我们意识到癌症的分类
按照简单的组织部位是不够的,药物的单一治疗效果也不理想(有效率仅有 20% )。比起
传统的病理报告,基因组测序信息能提供更加精准有效的分型诊断。要理解癌症,我们首
先要识别那些导致癌症风险的异常基因和蛋白质,才能更好地进行精确的癌症诊断和开发
针对性疗法。目前 NCI 开展多项临床研究,目标是使癌症的分子表征成为准确的诊断和治
疗的临床标准;鉴定和发展可匹配至肿瘤分子特点的疗法,成功地控制疾病。同时还开展
基因组学和癌症生物学,免疫学和免疫治疗,癌症成像等方面的研究来配合。【3】
癌症精准医疗需要基因检测和大数据分析来进行治疗用药指导。首先通过基因检测获
得患者基因变异的信息,如通过高通量测序方法(Next-Generation Sequencing ,
NGS )获得肿瘤DNA 的突变、基因拷贝数变异、基因移位和融合基因等海量基因变异信
息,这个环节的关键是检测技术的精确性及所检测标本所反映信息的全面性。组织样本的
主要来源是活检得到的肿瘤组织,缺点是异质性导致信息不全面或者由于动态的肿瘤基因
变化导致不准确,目前也有研究利用外周血中的游离肿瘤细胞或肿瘤 DNA 进行测序诊断
的。
现在全基因组测序还是比较昂贵并需要较长的分析时间,覆盖中等到低,对于关键低
频亚克隆突变检测不敏感,因此目前大多数的基础研究和临床应用都使用 NGS 针对目标
基因或全外显子组进行测序(这样测序成本可以降低 100 倍)。测序技术近些年已经经过
了四代发展,第一代技术 Sanger ,第二代以2005 年左右 Roche 公司的 454 技
术,Illumina 公司的 Solexa、HiSeq 技术和 Life Tech 公司的 SOLiD 技术为标志,优点是
通量大、精度高(99% )、价格相对低廉(千元以内),速度快(3-5 天),目前已经非
常成熟,是市场主流,但缺点是 reads (读长)较短,后期比对基因组数据和生物信息学
处理复杂。第三代(如 Pacific Biosciences 公司的 SMRT 单分子实时测序技术)利用
DNA 聚合酶,测序过程无需进行 PCR 扩增,可同时测甲基化,也可进行 RNA 测序,可
以提供更长的读长,但
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