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4-核酸的结构、功能与性质

核酸的结构、性质与功能 核酸的研究历史: ? 1868年,瑞士外科医生Fridrich Miescher从脓细胞核中分离到核酸样物质。 ?核酸分为DNA和RNA。DNA存在于细胞核和线粒体内,RNA存在于细胞质和细胞核内。 1944年,Oswald Avery通过肺炎双球菌转化实验证实了DNA是遗传的物质基础。 1953年 Watson和Crick 53-72年: 核酸的一级结构 戊糖 碱 基 互变异构效应?导致基因自发突变 由于DNA分子中的A、T、G、C四种碱基的第六位碳原子上的酮基(T、G)和氨基(A、C),T、G不是酮式就是烯醇式,C、A不是氨基式就是亚氨基式。T和G会以酮式和烯醇式两种互变异构的形式出现,而A和C则以氨基式或亚氨基式两种状态出现。由于化学结构的平衡一般趋向于酮式和亚氨基式,因此,在DNA双链结构中一般总是以AT与GC碱基配对的形式出现。可是在偶然情况下,T也会以烯醇式形式出现,恰好DNA的合成到达这位置的一瞬间,通过DNA多聚酶的作用,在它相对应的位置上出现配对碱基G,而不出现常规的A。当DNA再次复制时,通过G和C配对,就使原来的AT转变为GC。同样如果C以亚氨基形式出现,在DNA复制的合成到达这位置的一瞬间,DNA对应链上将是A,而不是G。 mutation ?在DNA和RNA中都有A、 G 、 C,T只出现在DNA分子中,U则只出现于RNA分子中。 核苷酸=核苷+磷酸 一般将细胞内染色体包含DNA的总体称为基因组。同一物种的基因组DNA含量总是恒定的,不同物种间基因组大小和复杂程度差异极大。真核生物具有复杂的染色体结构,其基因组DNA上存在着单一序列和大量重复序列,大多数真核基因都是不连续的,在成熟RNA中出现的部分称为外显子,在DNA拼接过程中被删除的部分称为内含子。原核生物基因组上功能相关的基因常常串连在一起并转录在同一mRNA分子中,形成多顺反子结构。某些病毒中会出现基因重叠。 DNA序列的测定-双脱氧链终止法 原理是采用核苷酸链终止剂—2、3双脱氧核苷酸终止DNA的延长。由于它缺少形成3-5磷酸二脂键所需要的3-OH,一旦参入到DNA链中,此DNA链就不能进一步延长。根据碱基配对原则,每当DNA聚合酶需要dNMP参入到正常延长的DNA链中时,就有两种可能性,一是参入ddNTP,结果导致脱氧核苷酸链延长的终止;二是参入dNTP,使DNA链仍可继续延长,直至参入下一个ddNTP。根据这一方法,就可得到一组以ddNTP结尾的长短不一的DNA片段。 ? ? ? ? ? ? ? ? 方法是分成四组分别为ddAMP、ddGMP、ddCMP、ddTMP反应后,聚丙烯酰胺凝胶电泳按泳带可读出DNA序列。 DNA序列测定全自动 DNA全自动测序 利用4种不同的荧光分子分别标记4种ddNTP。4个反应分开进行,产物合并在一个泳道中电泳分离,根据每条区带的荧光颜色不同加以识别读序,这样不但可提高每次分析样品的数量,又克服了泳道间差异造成的读序误差。与传统的手工测序比较:①安全,无污染;用荧光素代替同位素,避免了放射性同位素的污染和对人体的危害;②模板用量大大减小,单链DNA模板用量为0.4μg,双链DNA质粒模板用量为0.8μg,PCR产物用量为5ng~20ng;③测序长度大大提高,一般可达550bp~800bp。 核酸的二级结构 DNA的双螺旋结构 DNA三股螺旋(H-DNA,ts-DNA) 多聚嘧啶和多聚嘌呤组成的DNA螺旋区段,其序列中有较长的镜像重复时,形成局部三股配对,并互相盘绕的三股螺旋,其中两股的碱基按Watson-Crick方式配对,第三股多聚嘧啶(镜像重复)通过TAT和CGC+配对,而处于双螺旋的 大沟中。 DNA三股螺旋 DNA半保留复制的证明 Meselson与stahl(1958)用15N重同位素及密度梯度超速离心证明DNA复制是一种半保留复制。 E.coli.的一个温度敏感株,在42℃时,能使DNA在完成复制后,不再开始新的复制过程,而在25℃时复制功又能能恢复。 PCR PCR的理论基础是DNA的半保留复制 DNA的基本功能: 是生物遗传信息复制的模板和基因转录的模板,它是遗传的物质基础。 DNA的三级结构 三 DNA的三级结构 双螺旋进一步扭曲形成的超螺旋。是一种比双螺旋更高层次的空间构象。包括:线状DNA形成的纽结、超螺旋和多重螺旋、环状DNA形成的结、超螺旋和连环等 DNA的超螺旋 ?原核生物:大部分原核生物的DNA是共价封闭的环状双螺旋,这种双螺旋还可以再次螺旋化形成超螺旋。 ?真核生物:DNA和蛋白质组装成染色体,染色体的基本单位是核小体。 ?核小体由DNA和组蛋白构成。组蛋白有H1,H2A,H2B,H3和

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