[医学]3基因组.pptVIP

第三章 基因与基因组的结构 第一节 基因的概念 经典遗传学——基因是独立的功能单位、重组单位和突变单位。 类型 第二节 基因组(genome) 一、基因组概念 细胞或生物体一套完整单倍体的遗传物质的总称。 结构基因组学：以生物体的全基因组为研究对象，以及因作图、基因克隆、序列分析为主要内容，已建立高分辨率的生物遗传图谱、物理图谱、转录图普等为主要目的的研究。 二 C值矛盾 C值矛盾(C value paradox)：真核生物中DNA含量的反常现象。 1、C值不随生物进化程度的复杂而增加。 2、关系密切的生物C值相差很大 3、真核生物DNA的量远远大于编码蛋白质所需的量 解释：DNA的变性、Tm值、DNA复性、分子杂交、基因组、C值、C值矛盾、断裂基因、外显子、内含子、顺式作用元件、反式作用因子 1、DNA复性的影响因素有哪些？ 2、基因的类型有哪些？ 3、什么是原核生物？什么是真核生物？举例 三 病毒及其基因组 病毒基因组的结构特点 1、病毒基因组很小。 2、每种病毒只含一种核酸 3、常有基因重叠 4、病毒基因组有的是连续的，有的分节段； 5、病毒基因组大部分为编码序列； 6、功能相关基因转录为多顺反子mRNA。 重叠基因(overlapping gene) 1977年Sanger首先发现。 ?X174， 5386nt， 11 个基因，3个转录单位，由3个启动子（pA,pB,pD）控制。 非翻译区只占4%(217/5386) 重叠的方式 1 大基因内包含小基因： 2 前后两基因首尾重叠： ＊读框不同 四 细菌基因组 细菌基因组特点 第三节 真核生物基因组 二 真核生物基因组结构 1、断裂基因 2、内含子、外显子 3、基因组序列的异质性 核不均一RNA（hetero-geneous nuclear RNA）：细胞核内的RNA能以一系列非均一性的沉降速度沉降。 腺病毒双链DNA与它的mRNA 杂交时，电镜下观察到存在不与mRNA 配对的区段，形成R环。 对基因组DNA和cDNA 限制性内切酶图谱分析，也确定了不连续基因的存在 内含子发生的突变不影响蛋白质结构 ，内含子比外显子在进化上更迅速。 内含子在基因中的位置是相对固定的，第一内含子较短，第二个较长。 外显子与内含子连接处有很短的共同保守序列，个内含子两端没有任何广泛的序列同源性或互补性。 为什么要产生内含子，之后又把它剪掉？耗费巨大 内含子虽不编码基因但对基因表达有影响。 促进重组 增加基因组的复杂性 含有ORF 产生核仁小RNA 含有部分剪接信号 外显子和内含子是相对的 内含子对基因表达有影响 根据C0t曲线，真核基因组DNA分四类 单拷贝的DNA序列 低度重复DNA序列 中度重复DNA序列 高度重复DNA序列 2 低度重复顺序 在基因组中含有2-10拷贝，酵母tRNA基因、人和小鼠的珠蛋白基因等。 低度重复序列中发现假基因 DNA指纹 ( DNA fingerprints) 把小卫星DNA(VNTR)核心序列串联起来作为分子探针，与不同个体的DNA进行分子杂交，就会呈现出各自特有的杂交图谱，它们与人的指纹一样，具有专一性和特征性，因人而异，因此被称作“DNA指纹” 。 DNA指纹的特点： 1、多位点性2、简单的遗传方式 3、高度变异性  应用： DNA可以从犯罪现场的组织和体液中提取(经常是血液、精液或毛发)，然后与怀疑对象取得的对照样品比较。 三、基因家族和基因簇 1.基因家族（gene family） 真核基因组中，来源相同，结构相似，共能相关的一组基因。 基因家族成员在染色体上的分布形式不同 2. 基因簇(gene cluster): 基因家族中各成员紧密成簇排列成大段的串联重复单位定位与染色体的特殊区域。 原核生物：病毒基因组的结构特点 细菌基因组特点 真核生物：真核基因组的结构特点 名词解释：重叠基因、操纵子、多顺反子、断裂基因、RNA剪接、GT-AG法则、假基因、卫星DNA、DNA指纹、基因家族、基因簇、基因超家族 第四节 人类基因组 人类基因组草图基本信息 由31.65亿bp组成 含3-3.5万基因 与蛋白质合成有关 的基因占2% 人体的全部遗传信息，贮藏于细胞核中的 46 条 DNA 双螺旋大分子中. 二、人类基因组计划的科学意义 1、对人类基因组中约5万个编码基因作图，包括物理图、连锁图、转录图。从整个基因组结构的宏观水平上理解基因转录与转录后调节。 2、对基因组DNA进行裂解切割和基因克隆。 3、测定基因组全部DNA序列。 4、鉴定每个基因的功能。 5、建立基因的信息系