[高等教育]微生物研究进展chapter2-2 微生物基因组学研究进展.ppt

　遗传图（连锁图） 　指基因或DNA标记在染色体上的相对位置与遗传距离。cM（基因或DAN片段在染色体交换过程中分离的频率）　　 　 第一代多态性标记：RFLP 物理图 以已知核苷酸序列的DNA片段（序列标签位点，sequence-tagged site,STS）为“路标”，以碱基对作为基本测量单位（图距）的基因组图。 转录图 以EST（expressed sequence tag ，表达序列标签）为标记，根据转录顺序的位置和距离绘制的图谱。 序列图（分子水平的物理图） 序列图是指整个人类基因组的核苷酸序列图，也是最详尽的物理图。 既包括可转录序列，也包括非转录序列，是转录序列、调节序列和功能未知序列的总和。 二000年六月二十六日克林顿宣布 人类基因组草图绘制完成 在众多的组织相容性抗原系统中，能引起强烈而迅速 排斥反应的抗原系统，也叫主要组织相容性系统(MHS)。 ? 概述： 代表个体特异性的引起排斥反应的同种异型抗原，也称 移植抗原。 在不同个体之间进行组织器官移植时，受体和供体双方 相互接受的程度。 2、组织相容性抗原（histocompatibility antigen) 3、主要组织相容性抗原（major histocompatibility antigen) 1、组织相容性（histocompatibility) 编码MHS的基因是一组紧密连锁的基因群，称为MHC 。 5、MHC抗原 / MHC分子 4、主要组织相容性抗原复合体 （major histocompatibility complex，MHC) 表达于不同细胞表面，不仅决定着移植物的排斥反应， 还与免疫应答的诱导和调节有关。 MHC的编码产物。 人类白细胞抗原（HLA，human leucocyte antigen）： 人类的MHC首先发现于白细胞表面。 H－2与 HLA的基因结构、抗原分布和功能等都很相似。 各种动物的MHC 动物种 人 猩猩 恒河猴 狗 猪 兔 豚鼠 小白鼠 大白鼠 鸡 符 号 HLA ChLA RhLA DLA SLA RLA GpLA H-2 AgBH-1 B MHC Ⅰ 类分子参与内源性抗原的提呈 MHC Ⅱ 类分子参与外源性抗原的提呈 HLA 复合体的遗传特征 1、多态性 ⑴ 复等位基因（multiple allele） ⑵ 共显性（co-dominant） 造成器官移植的困难！ 按各个位点上的复等位基因计算，组成的基因型＞1亿。 2、单倍(元)型遗传 HLA基因紧密连锁，组成一个完整的遗传单位。 这些遗传特征使其在亲子鉴定，和器官移植时供者的选择 中得到应用。 遗传可能性： ⑴ 亲代与子代有一个单元型相同 ⑵ 同胞间两个单元型完全相同或不同的概率25% ⑶ 同胞间一个单元型相同的概率50% 同一基因座上HLA等位基因的差别可导致个体对某些疾病具有易感性或抗性。 HLA与疾病的相关性 强直性脊柱炎（ＡＳ）的病因未明，已证实，ＡＳ的发病和人类白细胞抗原ＨＬＡ－Ｂ２７密切相关，并有明显家族发病倾向。 症状: 　　早期主诉为下腰背发僵和疼痛，但背痛是普通人群中极为常见的一种症状，大多数为机械性（非炎性）背痛。故有必要将炎性背痛和机械性背痛加以区别。 炎性背痛的特点是：（１）背部不适发生在４０岁以前；（２）缓慢发病；（３）症状持续至少３个月；（４）背痛伴发晨僵；（５）背部不适在活动后减轻或消失。以上５项中有４项符合则支持炎性背痛。 B27的检测方法！ 各学科参与、协作：生命科学、数学、物理学、化学、计算机科学、材料科学以及伦理、法律等社会科学…… HGP带来的科学挑战 HGP: Pandoras Box ? 首要科学问题 如何找到记载在基因组DNA一维结构上控制生命时间、空间的调控信息的编码方式和调节规律。 应用数学、复杂系统理论、信息论、非线性科学…… 催生?生物信息学、计算生物学、系统生物学 ? DNA芯片技术 交叉性技术领域：物理学、微电子信息技术、生化技术、信息技术…… ? 结构生物学 前沿领域之一：生物物理学、生物化学、晶体学、波谱学、光谱学以及X射线晶体衍射技术、核磁共振技术…… 计算生物学和生物信息学 ——后基因组时代的呼唤 物理科学发展对生命科学的启示 面对堆积如山的生物学数据…… ……新的生物学研究模式的出发点应该是理论的。科学家将从理论推测出发，