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第二节 RNA的生物合成(转录)
第 二 节 RNA的生物合成(转录) RNA Biosynthesis (Transcription) 理解掌握DNA复制与RNA转录之异同 掌握真核与原核生物的RNA聚合酶结构和功能特点。 理解原核生物转录的过程。 掌握原核生物转录的终止的机制。 理解掌握真核生物转录后加工特点。 转录 (transcription) 生物体以DNA为模板合成RNA的过程 。 参与转录的物质 一、不对称转录 不对称转录(asymmetric transcription) 转录对DNA链的选择性称为不对称转录。 有两方面的含义: 在DNA分子双链上某一区段,一股链用作模板指引转录,另一股链不转录 ; 模板链并非永远在同一条单链上。 (2)真核生物的RNA聚合酶 已发现三种RNA聚合酶分别称为RNA聚合酶Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ,专一性地转录不同的基因,生成不同的产物i。 鹅膏蕈碱是真核生物RNA聚合酶的特异性抑制剂,但敏感性不同。 (三)转录的特点 1.不对称性 2.连续性 3.单向性 4.有特定的起始点和终止点 二 转录过程 The Process of Transcription (一)转录起始 就是RNA-Pol结合到DNA模板上的起始区域,DNA双链局部解开,一条链作模板面加入第一个、第二个NTP,RNA-Pol催化形成第一个磷酸二酯键。 转录起始复合物形成。 RNApol (?2????) - DNA - pppGpN- OH 3? 模板上酶的辨认、结合 原核生物一个转录区段可视为一个转录单位,称为操纵子(operon),包括若干个结构基因及其上游(upstream)的调控序列。 对启动子的研究方法RNA-Pol保护法 1)分离某段基因并与纯RNA-pol混合; 2)加入核酸外切酶(胰DNA酶)水解DNA; 3)分离被RNA聚合酶结合而未被水解的基因片段; 4)测定并分析保护区(40-60bp)的碱基序列; RNA-pol的移动 (二)转录延伸 ?亚基脱落,RNA–pol聚合酶核心酶变构,与模板结合松弛,沿着DNA模板前移; 在核心酶作用下,NTP不断聚合,RNA链不断延长。 (NMP) n + NTP ?? (NMP) n+1 + PPi 1、 转录空泡 RNA-Pol(核心酶)-DNA-RNA形成的转录复合物 RNA聚合酶可以覆盖40bp以上长度的DNA 转录解链范围小于20bp 杂化双链长度约12bp 2、原核生物转录过程中的羽毛状现象 (三)转录终止 指RNA聚合酶在DNA模板上停顿下来不再前进,转录产物RNA链从转录复合物上脱落下来。 2. 非依赖 Rho因子的转录终止 DNA模板上靠近终止处,有些特殊的碱基序列,转录出RNA后,RNA产物形成特殊的结构来终止转录。 茎环(stem-loop)/发夹(hairpin)结构。 举例: 大肠杆菌核蛋白体蛋白基因 大肠杆菌色氨酸操纵子 二、真核生物的转录起始 (一)转录起始 真核生物的转录起始上游区段比原核生物多样化。 转录起始时,RNA-pol不直接结合模板,其起始过程比原核生物复杂。 3. 转录起始前复合物(pre-initiation complex, PIC) 真核生物RNA-pol不与DNA分子直接结合,而需依靠众多的转录因子。 4. 模板理论(piecing theory) 拼板理论认为: 一个真核生物基因的转录需要3至5个转录因子。 转录因子之间互相结合,生成有活性,有专一性的复合物, 再与RNA聚合酶搭配而有针对性地结合、转录相应的基因。 (二)转录延长 RNA-pol前移处处都遇上核小体,二者大小差别不大。 转录延长过程中可以观察到核小体移位(仅见于试管内转录)和解聚现象。 (三)真核生物的转录终止 真核生物转录终止和转录后修饰密切相关。 1.真核生物DNA上有转录终止的信号,称为转录终止的修饰点。 已知真核生物DNA读码框架的3′端均含富含AT的序列(如AATAAA或ATTAAA等); 相隔0-30bp后又出现TTTT顺序(通常是3-5个T); 该结构可能与转录终止及3′端加polyA有关。 2.转录越过转录修饰点后的RNA在修饰点被切断,随即“加尾”、“戴帽”。 余下RNA继续转录,但产物很快被酶水解。 真核生物的转录终止及加尾修饰 三 转录后的加工 Post-transcriptional Modification 1、5?端帽子结构(m7GpppGp —)形成 2、PolyA的形成 3、hnRNA的剪接 1. hnRNA 和 snRNA 核内的初级mRNA称为杂化核RNA (hetero-nuclear RNA, hnRNA) mRNA来自hnRNA(去掉中间片段) snRNA (s
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