[理学]浙江大学生物无机化学课件chapter2.ppt

第2讲 生物无机化学的研究方法 Chapter 2 The Research Methods of Bioinorganic Chemistry 生物无机化学的研究内容 关注——生物金属在生命现象中的作用。 在分子、原子、电子水平上描述生物配合物的结构。 最主要的问题 1.生物配合物活性中心的配位结构，即中心金属离子的配位几何和配位环境； 2.中心金属离子的电子结构，包括电子云的分布、成键类型和电子能级； 3.生物配合物中的构象，即确定结构区域的二级、三级结构。 研究方法： 理论方法——量子化学与分子动力学 实验方法——获取生物活性分子结构。 功能以及作用机理信息的物理化学方法： 主要采用波谱技术。 波谱技术的原理 利用物质与电磁辐射的相互作用，即物质对电磁辐射的发生吸收、发射或衍射来获取有关信息。 吸收或发射对应于分子（原子、电子）量子化能级的能级间跃迁。 各种形式的波谱都有一个共同之处，即用给定频率的电磁辐射去作用样品。 由电磁辐射的频率及与之相联系的波长，可以求出相关的时标（即时间尺度），在此相关时间内采用有关的波谱方法探测化学现象。 常见波谱分析技术的时标(1) 常见波谱分析技术的时标(2) Boltzmann Distribution Law 除去样品条件，谱线的强度取决于两个因素： 1.体系中初始状态的粒子数； 2. 体系从一个状态改变到另一个状态的概率。 Boltzmann Distribution Law： 虽然一个分子停留在较低能态的概率很高，但它在稍高些的能级上仍有一定的停留概率，这两个态的相对布居数与达到较高能态需要的能量有关。 分子能级的相对布居数 Boltzmann Distribution Law Nu/N1=exp(-△E/kBT) 上式表示，在温度T，对于一个给定的分子集合N，若处于两个能态上分子的能级差为△E，则处在较低能态的分子布居数N1与处于较高能态的分子布居数Nu之间的关系。 kB=1.38066×10-23J·K-1 Boltzmann constant Boltzmann Distribution Law 如果能级差很小，激发态粒子数将大量增加，以致于两个临近态上的粒子数接近相等，这相当于温度无穷大，此时体系处于吸收和发射平衡的饱和状态，在这种情况下，谱线的强度很小，测定的灵敏度不高。 Jablonski能级图 Jablonski双分子能级图的说明 一般分子都处在电子自旋成对的基态S0，若吸收了足够的辐射能，就可以将一个电子激发到较高电子能级的激发态上去。 若激发态仍是单重态，则以S1、S2…表示； 若激发态为三重态（有两个成单电子且自旋平行），则以T1、T2 …表示。 三重态分子呈顺磁性，而单重态分子具有抗磁性。 在每一电子能级，分子还可以有能级间隔较小的振动能级和能隙更小的转动能级， 因此，当分子受到激发时，可能同时得到转动、振动和电子光谱。 驰豫过程（Relaxation Process) 能态布居的不相等是波谱测定的必要条件. 对于它的连续观察来说，需要某种从激发态返回基态的过程存在，从而保持低能级布居数始终大于高能级的布居数，这个过程称为驰豫过程。 除了发射光谱之外，体系还可以有其他的驰豫途径。 几种驰豫途径 荧光现象——分子的电子被激发到电子激发态下的较高振动能级后，可以通过碰撞失去多余的振动能（能量的内转换）达到最低电子激发态的最低振动能级，然后发射比入射频率低的荧光光子而回到基态。 磷光现象——电子激发态下的单重态到三重态的系间跨越，即两个能量接近但自旋不同的激发态间的过渡，然后再放出光量子回到基态的振动能级。 Franck-Condon Principle Franck-Condon原理指出：电子跃迁（特征时间为10-15 ～10-14s）与核的振动跃迁（特征时间为10-13 ～10-12s）相比进行得非常之快，当电子发生跃迁时，核位置来不及改变。因而可以认为，电子跃迁时原子核的位置固定不动。 利用Franck-Condon原理可以解释： 1.零谱带系的强度； 2.发射光谱中一个谱带系有两条强度最大的谱带的规律。 零谱带系 在一般情况（室温，无外界扰动）下，分子处于基态υ=0的概率最大，所以吸收光谱中与 υ=0相应的第一个υ’=0进行式带系的谱带最强，称为零谱带系。 应用Franck-Condon原理可以很好的解释零谱带系的强度分布： 当上下两个电子能级的势能曲线最低点的位置相近时，从 υ=0到υ’=0跃迁的可能性最大，强度也越强；如果上下两个势能曲线最低点的位置不同，跃迁到振动态υ’=0和可能性将不再最大。 Franck-Condon Principle 发射光谱中一个谱带系有两条强度最大的谱带的规律 根据Fra