毕业设计（论文）-基于反向找靶的天然产物活性研究精选.docxVIP

基于反向找靶的天然产物活性研究摘要利用计算机辅助药物设计（CADD）技术对Chinese Bittersweet Alkaloid (1) and (2)、Pubesenside A、2-氟代腺苷和腺苷的潜在靶标进行预测并对预测结果进行进一步的验证与分析。采用Pharmmapper网络服务器进行初步预测，并结合文献进行筛选与验证，然后采用Discovery Studio3.0（以下简称DS3.0）对靶蛋白与Chinese Bittersweet Alkaloid (1) and (2)、Pubesenside A、2-氟代腺苷和腺苷分子进行对接并对其相互作用进行进一步分析与讨论。结果Pharmmapper筛选结果显示Chinese Bittersweet Alkaloid (1) and (2)与表皮生长受体（Epidermal growth factor receptor以下简称EGFR）的结合较好，Pubesenside A与血管内皮生长因子受体2（Vascular endothelial growth factor receptor 2以下简称VEGFR-2）的结合较好，2-氟代腺苷和腺苷与β-内酰胺酶（Beta-lactamase）的结合较好。查阅文献发现EGFR是当前药物治疗非小细胞癌症的主要靶标，例如厄洛替尼、吉非替尼等[1]；VEGFR-2是当前治疗肾癌的主要靶标，例如索拉菲尼等；Beta-lactamase是著名抗生素-青霉素的靶标。DS3.0的对接结果也显示Chinese Bittersweet Alkaloid (1) and (2)尤其是（2）与EGFR具有静电作用、氢键、范德华力、Pi——Pi键等相互作用；Pubesenside A与VEGFR-2之间具有静电作用、氢键、范德华力等相互作用；2-氟代腺苷和腺苷尤其是2-氟代腺苷与Beta-lactamase之间具有静电作用、氢键、范德华力、Pi键等相互作用。本次实验就Chinese Bittersweet Alkaloid (1) and (2)与厄洛替尼相比较分别与EGFR进行分子对接；Pubesenside A与索拉菲尼相比较并与VEGFR-2进行分子对接；2-氟代腺苷和腺苷与青霉素相比较并分别与青霉素进行分子对接。并比较得出结论：Chinese Bittersweet Alkaloid (1) and (2)的潜在靶标最有可能是EGFR。而且无论是在Pharmmpper的筛选结果还是在DS3.0中的对接结果来看Chinese Bittersweet Alkaloid (2)与受体EGFR的对接匹配度以及分子间相互作用的强度明显高于Chinese Bittersweet Alkaloid (1)。Chinese Bittersweet Alkaloid (2)可能是治疗非小细胞肺癌理想的新型化合物。有望成为现如今非小细胞肺癌靶向药物出现耐药性的替代药物，以及出现严重不良反应时的替代药物。Pubesenside A的潜在靶标最有可能是VEGFR-2，Pubesenside A可能是治疗肾癌的理想的新型化合物，有望成为代替索拉菲尼进行肾癌治疗。2-氟代腺苷和腺苷的潜在靶标可能是Beta-lactamase，2-氟代腺苷和腺苷有望成为新型抗生素来代替青霉素等一些已经出现耐药性的抗生素的替代药物。关 键 词：CADD;Pharmmapper，Discovery Studio3.0，潜在靶标，对接论文类型：基础研究Study on the activity of natural products based on reverse targetingABSTRACTThe potential targets of Chinese Bittersweet Alkaloid (1) and (2), Pubesenside A, 2-fluoroadenosine and adenosine were predicted by computer-aided drug design (CADD) technique and the results were further validated and analyzed.Pharmmapper network server for preliminary prediction, combined with the literature for screening and validation，The target protein was then docked with Chinese Bittersweet Alkaloid (1) and (2), Pubesenside A, 2-fluoroadenosine