利用高通量测序检测复杂群落中稀有生物区系的生物多样性.PDFVIP

利用高通量测序检测复杂群落 中稀有生物区系的生物多样性 战爱斌 中国科学院生态环境研究中心 2015年1月20日 水生生物多样性丧失 栖息地丧失 生物入侵 污染 过度渔猎 4600淡水动物濒危或灭绝，占所有淡水动物的25％ Thomsen et al. (2012) Molecular Ecology 我国水生生态系统的生物多样性丧失 水生生态系统污染问题严峻 -化学品：中国大量使用1万种 -工农业、生活污水 生物多样性空间分异 1、驱动因子是什么？ 1、过程是什么？ 2、机理是什么？ 稀有生物区系 稀有生物区系（Rare biosphere） 群落中所有低丰度生物的集合 污染生态学研究的关键 生物入侵早期检测的关键 检测阈（Veil线） 检测阈（Veil线） 方法学挑战 稀有/濒危生物 灾害生物 世界性难题 －匿藏于水下 －水域广袤 －绝大数物种个体微小 －可利用的外部形态极少 －群体数量及密度极低 方法学挑战 常规方法的检出率0.2 解决方案 高通量测序 亟待回答的方法学问题 1. 稀有生物检测限问题 2. 稀有生物检出的重复率问题 3. 数据滤错对稀有生物检出的影响 4. 序列丰度与生物量之间的关系 300300300 9.5x9.5x9.5x 传统形态学传统形态学传统形态学 物物物 200200200 焦磷酸测序焦磷酸测序焦磷酸测序 单体（singletons ） 5.6x5.6x5.6x 种种种 数数数