《现代分子生物学》第六章1蛋白质的生物合成.ppt

第六章 蛋白质的生物合成 蛋白质生物合成又称翻译（translation），是指由RNA参与的蛋白质生物合成的过程，它将核酸的碱基序列转变为蛋白质中的氨基酸序列。 参与翻译的RNA分子有tRNA、rRNA和mRNA。tRNA的功能是转运氨基酸，rRNA与多种蛋白质组成核糖体作为翻译进行的场所，mRNA作为翻译的模板。 经过三种RNA以及多种蛋白质的相互作用，使来自DNA的遗传信息正确地传递到蛋白质。 第一节 遗传密码 一、遗传密码 遗传密码（genetic code）是联系核酸的碱基序列和蛋白质的氨基酸序列的途径。mRNA上由三个碱基代表一种氨基酸，称为密码子（codon）。 生物体内存在多个密码子代表一种氨基酸的情况。 遗传密码的特点 (1) 遗传密码是三联体密码。 (2)遗传密码无逗号。 (3)遗传密码是不重迭的。 (4)遗传密码具有通用性。 (5)遗传密码具有简并性(degeneracy (synonyms)。 (6) 密码子有起始密码子和终止密码子。 (7) 反密码子中的“ 摆动”（wobble） 除甲硫氨酸和色氨酸外，其他的氨基酸均有两种以上的密码子。多种密码子编码一种氨基酸的现象称为简并（degeneracy），代表同一种氨基酸的密码子称为同义密码子（synonyms）。 氨基酸的密码子数目和它在蛋白质中出现的频率并没有明显的正相关性。 在所有的生物体内，密码子字典几乎是通用的，这已被体内和体外的翻译实验所证实。 线粒体的遗传密码子存在较多的例外情况，其中最常见的一种变化是UGA由终止密码子变为色氨酸的密码子，这可能是进化上最早期的变化。 二、密码子和反密码子的相互作用 密码子决定氨基酸是通过mRNA与tRNA相互作用实现的，这种作用实质上是碱基间的配对。 密码子与反密码子（anticodon）间的正确识别是遗传信息正确传递的保证。 一般来说，生物体内tRNA的种类要少于编码氨基酸的密码子。密码子的前两位碱基在和反密码子配对时遵循Watson-Crick原则，而第三位碱基则有一定的灵活性，这就是摆动假说（wobble hypothesis）。 在不同生物体内，存在多种方式使少数的tRNA识别61种编码氨基酸的密码子，不同的生物所采用的途径也不同。 tRNA分子中含有较多的修饰碱基。位于反密码子中的或其他位置的修饰碱基均会对密码子和反密码子的作用产生影响。 第二套密码系统 1988年，Christian deDuve在Hou和Schimmel等人的研究基础上，提出了第二套密码系统的概念或学说。该学说认为: tRNA氨基酸接受柄有一辅密码区(paracodon region)，可以被氨基酰tRNA合成酶(aaRS)识别，并决定tRNA的负载特异性。他认为第二套密码系统蕴含于aaRS结构中 。 与经典密码系统不同。辅密码子密码系统或第二套密码系统是非简并性的(non-degenerate)。可能只有20种aaRS，每种aaRS能够识别特异于某种氨基酸的所有tRNA，这种识别与该种特异tRNA的不同特征有关。第二套密码系统比经典的密码系统对氨基酸更具有决定性，这与辅密码子和相应的氨基酸间的立体化学相互反应有关。 Christian deDuve认为，第二套密码系统仅仅是辅密码子与aaRS-aa-AMP或aa-aaRS复合物的一个简单反应，而tRNA则起着删除错误氨基酰的作用 。 aaRS上的某些区域含有一些残基可与辅密码子的核苷酸反应，但无法把所有氨基酸侧链与tRNA的核苷酸匹配起来。因此，一些科学家提出第二套密码系统存在于tRNA分子本身，而不应存在于aaRS结构中。 第二套密码系统比经典的密码系统更原始。一些作者猜测tRNA起源于携带氨苷酰的寡核苷酸，其原始形式能与氨基酸直接反应。 破译第二密码系统的意义不仅仅限于tRNA分子本身生物学功能的认识，更重要的是将对生物化学，生物起源，分子生物学及遗传学产生重大影响。 第二节 tRNA的功能 所有的tRNA都有相同的二级（三叶草型）和三级结构（倒L型）。这种结构上的一致性是其功能所必需的。因为不同的tRNA分子都具有相同的功能特征。 tRNA在翻译中转运氨基酸的作用，将氨基酸经过密码子与反密码子的相互识别定位在肽链中。从这一点上看，tRNA是起具体翻译作用的分子。 tRNA的结构 tRNA的结构 1. 三叶草型的二维结构 (1)各种tRNA均含有70~80个碱基，其 中22个碱基是恒定的。 (2) 5’端和3’端配对（常为7bp）形成茎区，称为受体臂（acceptor arm）或称氨基酸臂 。在3’端永远是4个碱基（XCCA）的单链区，在其末端有2’-OH或3’-OH，是被氨基酰化位点。此臂负责携带特异的氨基酸。 （3）TψC常由5bp的茎和7