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理论计算基础
计算机辅助药物设计
理论计算基础
1
理论计算基础
1 ChemOffice软件
2 量子化学 5 溶剂效应
3 分子力学 6 自由能计算
4 分子动力学 7 实例介绍
2
1 ChemOffice
3
ChemDraw
4
Drawing Chemical Structures
Analysis
5
Configuring Settings for Documents
6
Automatic Drawing—Structures from
Chemical Names
7
Adding Chemical Names
The TLC Tool
8
课堂练习：ChemDraw软件操作
1） 在ChemDraw 中画出结构式。
2）标出药物分子的化学式、分子量以及其元素分析。
3）标出药物分子的化合物标准命名。
4）描述一个有五个泳道的TLC ，其中有一个点的Rf值为0.5
，并标出所用样点的Rf值。其中必须包括显色、拖尾、中
空的样品点。
9
Chem 3D
10
Chem 3D
11
课堂练习：Chem3D 软件操作
5）将化合物导入到Chem3D 中。
6）对化合物标明每个原子的名称和编号。
7）对化合物进行能量最小化，并存为mol2格式文件。
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2 量子化学
以量子力学的基本原理和方法来研
究化学问题的学科。
从微观 角度，阐明物质的反应性以
及结构和性能关系。
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2.1 薛定谔方程
量子力学中一个基本方程
描述微粒运动 的规律
定态薛定谔方程— 只与空间有关
的函数
求解方程的主要方法
从头计算
半经验计算
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