珠江口江豚和中华白海豚的系统发育地理学研究推荐.doc

珠江口江豚和中华白海豚的系统发育地理学研究 PAGE PAGE I 中山大学博士学位论文 珠江口江豚和中华白海豚的系统发育地理学研究 珠江口江豚和中华白海豚的系统发育地理学研究 专业：生物化学与分子生物学 摘要 中华白海豚和江豚是两种长期生活在珠江口水域的鲸豚类，分别是国家一级和二级保护动物。近年来，珠江口水域环境受人类活动影响而污染越来越严重，对鲸豚类产生巨大的威胁。因此，目前对珠江口鲸豚类的保护十分紧急。本文从保护遗传学和系统发育地理学的角度，用群体遗传学和系统发育学的方法，对在珠江口水域生存的中华白海豚和江豚进行了研究。 保护遗传学研究种群的遗传分化程度，从而为划分独立保护单元提供依据，是对濒危物种进行保护管理的基础。系统发育地理学研究物种分化和地理分布的关系，有助于理解珠江口水域鲸豚类的进化历史。 对珠江口江豚种群，本文首先通过用11对物种特异性微卫星引物对珠江口的75头江豚进行了遗传分型，探讨了珠江口江豚的内部群体结构。其次，本文提出了关于珠江口江豚的起源假说，并通过线粒体DNA细胞色素b序列去研究珠江口江豚在整个新鼠海豚属中的系统发育地位。最后，本文用中国水域315个江豚样本的线粒体DNA控制区序列，研究了中国水域江豚种群的结构和珠江口江豚种群和其他种群的分化程度，为珠江口江豚种群的保护工作提供依据。 对珠江口中华白海豚种群，本文首先研发了多态性较好的中华白海豚物种特异性微卫星引物，为下一步的保护遗传学工作打好基础。其次，本文用细胞色素b标记研究了中华白海豚各种群和同属的其他白海豚系统发育关系，分析了珠江口中华白海豚的演化历史。 本文的主要研究结果如下： 1. 通过对珠江口75头江豚个体的11个位点的微卫星位点分析，STRUCTURE结果显示珠江口江豚的内部群体没有发生分化。 2. 通过对中国水域江豚群体的分析，AMOVA结果显示，珠江口江豚群体显著分化于其他种群, 建议将其划分为独立的保护管理单元。 3. 通过自动校正的进化速率的Bayesian方法和细胞色素b基因单倍型，分别探讨了新鼠海豚属和白海豚属的各个种族的系统发育关系和分化时间。研究发现，新鼠海豚属内部的分化时间为9.01MYA。白海豚属的内部分化时间为1.27MYA。 4. 通过系统发育学研究发现珠江口江豚比长江江豚或渤海的东亚江豚更为古老。 5. 通过快速磁珠法（FIASCO）研发了多态性较好的中华白海豚特异性引物。 关键词：中华白海豚，江豚，保护遗传学，系统发育地理学，进化  Phylogeography of Neophocaena phocaenoides and Sousa chinensis in the Pearl River Estuary Major: Biochemistry and Molecular Biology Name: Duan Gui Supervisor: Professor, Yuping Wu ABSTRACT Chinese white dolphins (Sousa chinensis) and finless porpoise (Neophocaena phocaenoides) are two small cetaceans found residential in Pearl River Estuary (PRE). Pearl River Estuary has been developing extremely fast in the past several decades, which increased the pressure for local marine species. Our work contributes to the conservation genetics and phylogeography of Chinese white dolphins and finless porpoise in PRE. Since the recent recognition of two species in the genus Neophocaena, knowledge regarding the Indo-Pacific finless porpoise (N. phocaenoides) remains lacking, including the population structure within the species and its phylogenetic relationship with the other taxa of Neophocaen