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差异蛋白质组学
蛋白质组学 “完全”蛋白质组学 目的是检测一种细胞类型或一种组织内基因组表达的所有蛋白质。 “差异”蛋白质组学 主要是筛选和鉴定不同种类或状态下各样本之间蛋白质组的区别和变化。 差异蛋白质组的研究 完全蛋白组一度吸引了大量研究者,但是人们逐渐认识到在短时间内建立蛋白质组学“完整的”数据库和实现网络共享是难以实现的,或者说条件尚未成熟。 差异蛋白质组学则着重于寻找和筛选任何有意义的因素引起的两个样本之间的差异蛋白质谱。其研究在技术上有更高的可实现性。 差异蛋白组研究的可实现性 目前对蛋白质组学的研究仍采用传统技术,例如双向电泳、质谱。双向电泳虽然仍然是目前可以分辨最多蛋白质种类的技术,但其无法检测疏水性蛋白、极端pH的酸性蛋白和碱性蛋白以及某些低丰度蛋白,因此远不能捕获细胞内的全部蛋白质。质谱虽有高分辨率和高灵敏度,但其需要在样品检测之前进行必要的纯化,因而无法实现高通量的蛋白质分析。 差异蛋白质由于不需要捕获全部蛋白质,而重在找出有意义的差异蛋白,所以有高得多的可实现性。双向电泳在差异蛋白组分析中仍是一项重要的技术。美国Ciphergen公司研发的基质辅助激光解析离子化系统集分离纯化和质谱检测于一身。可直接检测相对原始的生物样品,并可同时进行多样品多蛋白的检测,从而提供了适合于差异蛋白质组学研究的可比较性系统。此外,同位素标记技术是质谱技术在蛋白质定量研究方面的能力大大提高,有助于差异蛋白组学研究的进展。 差异蛋白组学反映了蛋白质的动态本质 一个生物体在经历生长、发育及各种生理过程甚至病理过程中,其基因组通常是保持不变的,也即它可能表达的全部蛋白质的总和也是不变的,而其蛋白组的构成却在随时发生着严格而活跃的改变。每个细胞在不同功能状态、不同细胞周期、接受不同条件因素刺激,蛋白组会发生相应的改变。正是这种不同的蛋白质组构成了这一细胞这一时刻的特征性生命活动的基础。因此差异蛋白组的研究是认识生命活动本质的一个恰当而直接的途径。 研究方法 双向电泳 用于蛋白质定量研究和比较研究的质谱相关技术。 SELDI蛋白质芯片技术 应用 疾病的早期诊断、病程及疗效监测 环境因素影响分析 农业育种 基因工程产物的鉴定 食品蛋白质评价 * 差异蛋白质组学及其应用 *
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