[工学]第三章 蛋白质3.ppt

生 物 化 学 第三章 蛋白质 补充：人体必需的八种氨基酸 人体必需氨基酸有八种： Met Trp Lys Val Ile Leu Phe Thr “假 设 来 借 一 两 本 书” §3.4 蛋白质的三维结构 为表示蛋白质结构的不同组织层次，经常使用一级结构、二级结构、三级结构和四级结构这样一些专门术语 一、研究蛋白质构象的方法 构象：当单键旋转时，不同取代基团可能形成的不同的立体结构 蛋白质的多肽链在生物体正常的温度和pH条件下只有一种或很少几种构象→保证了其生物活性且相当稳定 →天然蛋白质主链上的单键不能自由旋转 研究方法： X射线衍射法 紫外、荧光光谱、圆二色性 核磁共振 1、X射线衍射 1、X射线衍射：只能用于测定晶体结构→Ｘ射线晶体学 不能直接用来测定单个分子的结构 2、紫外差光谱 蛋白质分子中含有的芳香族和杂环族共轭环结构（发色团）使得其在近紫外光区域具有光吸收能力 发色团的吸光性质与其结构相关，结构又受其微环境影响 当发色团暴露在蛋白质分子表面时，pH和溶剂性质的影响是主要的；若埋藏于分子内部，则以邻近基团的影响为主 3、荧光光谱 荧光的产生：物质吸收紫外光后，发射出的比入射波长更为长的光（一部分以热形式散失，一部分激发能级跃迁，一部分将以再辐射的形式散发出去，辐射出的能量总小于吸收的总能量） 蛋白质中Trp、Tyr残基在紫外光激发下能够产生荧光 这些残基的微环境（内源性荧光）能明显地改变其荧光强度和荧光峰位置 4、圆二色性 圆二色性（circular dichroism），CD: 生物分子具有不对称性→不同构象的生物分子对于左、右圆偏振光的吸收能力不一 左、右圆偏振光被生物分子吸收后→吸收不同而叠合成椭圆偏振光→用摩尔椭圆率表示 不同构象的圆二色性光谱不同→反映主链构象 5、核磁共振（NMR）nuclear magnetic resonance 原子核带正电荷，只要自旋量子数不等于零，其行为就像绕轴自旋的小磁体→与外加磁场相互作用，1H、2H、13C 当无外磁场存在时，磁核的自旋是随机的，而当含有自旋核的样品置于磁场中时，自旋的小磁场与外磁场平行或反平行（只有2种取向） 已取向的核用电磁辐射照射时，会发生能量吸收，从低能自旋态变为高能态→核与外加磁场共振 二、维系蛋白质三维结构的作用力 二、维系蛋白质三维结构的作用力 三、多肽主链折叠的空间限制 肽键平面 肽键平面——可能与不可能的构象 肽键平面Ramachandran空间构象分布图 四、二级结构：多肽链折叠的规则方式 二级结构：蛋白质主链的折叠产生由氢键维系 的有规则的构象。 主要有：?-螺旋、?-折叠、?-转角。 这些结构可在一条多肽链的不同区段形成。 α螺旋—3.613-螺旋 α －螺旋螺旋的其它形式 羧基端的后三个肽键内C＝O不能形成α螺旋氢键 左手α-螺旋与右手α-螺旋 侧链对α螺旋的影响 使α螺旋不稳定的因素…… 1）临近侧链同为正电荷或负电荷的排斥作用 如poly Lys pH＝12、poly Glu 2）若重复出现Asn，Ser，Thr，Leu，Ile等较大R基的aa→其形状大小对螺旋阻碍作用。 较大的空间阻碍→难于形成α-螺旋 β折叠片 反向平行β折叠片 平行β折叠片 β折叠片 其它形式 无规卷曲 是有序的非重复结构→肽段有更大的任意性。 受氨基酸残基侧链的影响较大，经常是构成酶活性部位和其它蛋白质特异的功能部位。 五、纤维状蛋白质---与多肽链的有规则二级结构有关 纤维状蛋白质fibrous protein：是动物体的基本支架和外保护成分，占脊椎动物体内蛋白质总量的一半或以上 1、?-角蛋白 存在于毛发、指甲、爪、角和鸟喙 烫发的生物化学机理 2、?-角蛋白 3、胶原蛋白一种三股螺旋 胶原蛋白 胶原纤维可以通过分子内和分子间的交联得到进一步增强和稳定 胶原的某些Lys可在含铜的赖氨酸氧化酶作用下发生氧化脱氨→ε醛基赖氨酸→易发生多种共价交联反应 年龄↑共价交联键增多，结缔组织（肌腱、韧带、软骨、眼球角膜）中的胶原纤维越来越硬而脆 4、 弹性蛋白 是结缔组织中的另一种蛋白质，使肺、血管及韧带等具有伸展性 由可溶性的单体——原弹性蛋白经过交联合成的 六、超二级结构和结构域 1、超二级结构：若干相邻的二级结构单元组合在一起，彼此相互作用，形成有规则、在空间上能辨认的二级结构组合体，充当三级结构的构件，主要存在于球状蛋白 球状蛋白质αα 纤维状蛋白质α 螺旋束是由几条链的α 螺旋缠绕而成 球状蛋白质βαβ与β β 2、结构域 结构域：在二级结构或超二级结构的基础上组合形成的三级结构的局部折叠区域，是相对独立的紧密球状实体，球状蛋白质的独立折叠单位 小的球状