无创产前DNA检测技术及应用.docVIP

北京市科学技术奖申报推荐书 技术开发类K41-2017-045 专业评审组 药物与生物医学工程 无创产前DNA检测技术及应用 Development and Application of the Non-invasive Prenatal Testing 候选单位 1.安诺优达基因科技（北京）有限公司 陈重建,梁峻彬,李大为,玄兆伶,陈洋,王霜 北京经济技术开发区科技局 崔春雷 联系电话 基因工程 4164010 2 基因组学 1803710 3 优生学 33074 所属国民经济行业 所属科学技术领域 生物医药 G 企业 企业自主开发项目 项目起始时间 201205 项目完成时间 201212 成果登记号 9112017Y410 二、项目简介（可公开宣传） 简要介绍三部分内容：1.研究目的；2.主要技术创新点；3.成果产生的价值。（限600-1000字） 一、研究目的 该项目以我公司自主知识产权的无创产前DNA检测技术为核心，采用新一代高通量测序技术结合生物信息学分析方法，对孕妇外周血中的胎儿游离DNA进行检测和分析，判断胎儿是否患染色体非整倍体疾病，准确率高达99％。在检测过程中，假阳性的发生主要是由于母体胎盘嵌合以及孕妇本人存在染色体异常所致。为了降低假阳性率，更好地服务于临床，公司对测序的全过程，包括血浆样品处理、测序实验步骤和数据解读等诸多方面进行了优化和标准化处理，研发了独特的胎儿游离DNA提取优化技术及建库连接效率优化专利、专有的技术母体CNV过滤系统等，可有效提高准确率，大幅降低假阳性率。 二、主要技术创新点 1、高效的血浆游离DNA提取技术 由于孕妇血浆中胎儿游离DNA占的比例比较小，通常是4％-10％，所以准确的判断胎儿的染色体数目异常就需要高效的提取血浆中胎儿的游离DNA。公司开发和优化的血浆游离DNA提取技术可以从200μL血浆中高效的提取胎儿的游离DNA，从而保证检出结果的准确性；我们公司经过优化后能够从200ul血浆中提取到足够多的游离DNA，并且保证结果的准确、可靠。 2、独特的引物设计，建库方法更简便、检测染色体缺陷更快速。 独特的半特异性扩增引物可以对人类基因组进行部分扩展，针对该区域进行更深的测序深度，由于测序深度的提高，大大降低了数据分析过程中的背景噪音，使得研究分析的范围更精准，同时也大大降低了检测成本。 3、创新的生物信息分析流程 胎儿核型的判断涉及到一套复杂的生物信息分析算法的开发，安诺优达在检测过程中积累了大量的样本数据库，并开发出一套独特的分析算法，在此基础上发表的排除母亲基因型的干扰从而提高NIPT检测准确率的文章也得到学业界专家一致认可。该技术已经进入专利审查阶段，相关研究成果已发表在Nature子刊Scientific Reports。 三、成果产生的价值 本项目为临床上提供了一种新型、准确的产前筛查方式，解决了传统筛查因低检出率而导致的严重“漏诊”问题，且无流产及感染风险，具有较高的科学价值。相比于传统产前筛查和诊断而言，具有显著优势： 1、无创：无创伤取样，仅需抽取10mL孕妇外周血； 2、安全：无需侵入孕妇体内，无流产及宫内感染风险； 3、精准：基于新一代高通量DNA测序技术，准确率高达99％以上； 4、检测孕周范围广：在孕12+0周至26+6周均可以进行检测； 5、检测周期短：10个工作日即可出具检测结果。三、主要科技创新 3.1研究背景和总体思路 一、研究背景1997年香港中文大学卢煜明教授，通过用PCR法扩增母体外周血浆中Y染色体特异的DNA片段，证明母血浆中存在胎儿游离DNA（cell-free fetal DNA，cffDNA）。基于这些早期发现，展开了一系列工作来研究这些胎儿游离DNA的特性，证明了使用胎儿游离DNA来诊断遗传性疾病的可行性和实际性，这种革命性的方法为全球无数的孕妇提供了无创产前诊断，开创了基因测序检测唐氏综合症的新途径，并在90多个国家得到了应用。仅在中国，每年就有超过一百万孕妇接受无创产前DNA检测（NIPT）测试，深圳市、重庆市、湖南等省市更是将NIPT检测项目纳入医保。 二、总体思路 NIPT以其无创、安全、更精准以及更早的检测孕周等优势得到了广泛应用，但该技术还存在一定的局限性，比如假阳性结果的存在，NIPT假阳性结果，主要受母体基因族中存在拷贝数变异（CNV）他的存在会干扰胎儿染色体非整倍性的计算，导致假阳性结果的产生。除此之外，NIPT在推广方面还面临经济性难题，目前该项目只在产前血清学筛查高危、中等风险的孕妇中有较高的应用率。因此，不仅需要在检测效率方面做技术改进，成本优化，降低消费者负担，也是亟待解决的问题。 因此针对NIPT的局限性，公司开展