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琼脂糖凝胶电泳分离dna片段中南民族大学
Your company slogan LOGO 琼脂糖凝胶电泳分离DNA片段 中南民族大学 药学院 化学生物学教研室 琼脂糖凝胶电泳分离DNA片段 1 实验目的 2 实验原理 3 仪器与试剂 4 实验步骤 5 注意事项 药学院 化学生物学教研室 1.实验目的 学习用琼脂糖凝胶电泳检测DNA的纯度、浓度、构型及其相对分子质量大小的方法。 药学院 化学生物学教研室 2.实验原理 text1 text2 text3 琼脂糖凝胶电泳和聚丙烯酰胺凝胶电泳是分离、鉴定和纯化DNA片段的标准方法。该技术操作简便快捷,可以分辨用其他方法(如密度梯度离心法)无法分离的DNA片段。用低浓度的嵌入式荧光染料溴乙锭(EB)染色,在紫外光下可以检出1~10ng的DNA条带,从而可以确定DNA片段在凝胶中的位置。聚丙烯酰胺凝胶电泳分离1kb以下的小片段DNA效果较好,甚至可以分辨相差1bp的DNA片段。聚丙烯酰胺凝胶电泳速率快,容量相对较大,采用垂直装置进行电泳,但制备和操作比琼脂糖凝胶电泳困难,常用于核酸的序列测定。琼脂糖凝胶电泳的分辨率比聚丙烯酰胺凝胶电泳低,但其分离范围广,不同浓度的琼脂糖凝胶电泳可分离DNA片段的范围为200bp~50kb,通常在水平装置上进行,操作简便。 药学院 化学生物学教研室 3.仪器与试剂 (1)天平 (2)电炉 (3)制胶槽 (4)电泳仪 (5)电泳槽 (6)荧光成像仪 (7)移液枪 仪器 text2 试剂 (1)0.5 × TBE 电泳缓冲液:54g Tris、27.5g硼酸、3.72g二水合EDTA二钠盐,用水定容至1000mL。使用时稀释10倍。 (2)EB溶液:称取EB溶于无菌水中,母液浓度1mg/mL,4℃避光保存。 (3)相对分子质量标准(100bp,DNA标准物) (4)6 ×点样缓冲液(0.25%溴酚蓝,400g/L蔗糖) (5)琼脂糖 (6)扩增好的毛囊DNA样品 药学院 化学生物学教研室 4.实验步骤 (5) 电泳 (4) 点样 (3) 装配 (2) 制胶 (1) 溶解 药学院 化学生物学教研室 4.实验步骤 (1) 称取0.4g琼脂糖于150mL三角瓶中,加 入20mL 0.5×TBE电泳溶液,置电炉上加热溶解(注意要经常晃动,避免过热溢出!),制成2%琼脂糖溶液。 琼脂糖 药学院 化学生物学教研室 4.实验步骤 (2)将琼脂糖溶液冷却至60℃左右,加入5μL浓度为1mg/mL的EB溶液(戴手套!),摇匀,立即小心倒入准备好的胶模槽中(已插好梳子),使琼脂糖溶液在槽中的厚度为3~5mm,排除梳齿上的气泡(一般轻轻抖动梳子或用小针头挑一下即可)。 药学院 化学生物学教研室 4.实验步骤 (3)室温下放置30~40min,使凝胶完全凝固后,加入少量0.5×TBE电泳缓冲液,小心拔出梳子,将胶膜放入电泳槽中(注意加样端接负极),加入适量0.5× TBE电泳缓冲液,使液面高出胶面约1mm 药学院 化学生物学教研室 4.实验步骤 (4)用移液枪取10μL PCR扩增样品和2μL点样缓冲液混匀,用移液枪将样品加入凝胶的加样孔中,注意枪头不可穿透孔底。另取10μL相对分子质量标准液(已和加样缓冲液混匀),同法加样至另一泳道的加样孔。记录样品点样顺序(泳道)与点样量。 药学院 化学生物学教研室 4.实验步骤 (5)开启电源开关,接通电泳槽和电泳仪,注意DNA向正极移动,加样端要接负极。调节电泳电压为100V。在电泳途中可用紫外灯直接观察,DNA各条区带分开后,电泳结束。 药学院 化学生物学教研室 5.注意事项 (1)EB为强致癌物,注意避免接触皮肤,使用时一定要戴手套。 (2)紫外光对眼睛有害,观察电泳结果时最好戴上防护镜或眼镜,或隔着玻璃或有机玻璃观察。 WARNING 药学院 化学生物学教研室 6.思考题 简述琼脂糖凝胶和EB染料在电泳分离DNA中的作用。 药学院 化学生物学教研室 Your company slogan LOGO
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