流体剪切力对内皮细胞miR21和miR199a表达的影响-生物信息学.PDFVIP

流体剪切力对内皮细胞miR21和miR199a表达的影响-生物信息学.PDF

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流体剪切力对内皮细胞miR21和miR199a表达的影响-生物信息学

第 14卷 第 1期 生 物 信 息 学 Vol.14 No.1                     2016年03月 Chinese Journal of Bioinformatics Mar. 2016 - doi:103969/ j.issn.1672 5565.2016.01.04 流体剪切力对内皮细胞miR⁃21和 miR⁃199a表达的影响 1,2,3 3 1 ∗ 1 1 张  燕 ,王玉彩 ,刘振东 ,赵颖馨 ,张  华 (1.山东省医学科学院基础医学研究所,济南 250062; 2.济南大学,山东省医学科学院医学与生命科学学院,济南 250022; 3.山东省齐河县人民医院,山东齐河 251100) 摘  要:为探讨流体剪切力对内皮细胞micorRNAs 表达的影响。 采用旋转锥形圆盘剪切力系统对内皮细胞分别加载低(4 2 2 2 dyn/ cm )、中(10 dyn/ cm )和高(15 dyn/ cm )3种不同梯度的剪切力作用24h。 对照组未加载剪切力。 采用高通量筛选芯片检 测microRNAs表达变化,qRT⁃PCR验证,并进行生物信息学分析。 与对照组比较,低剪切力组表达差异的microRNAs 有33个 (FC>1.5或<0.5倍,P<0.05),其中28个上调,5个下调;中剪切力组表达差异的microRNAs有8个(FC>1.5或<0.5倍,P<0.05), 其中6个上调,2个下调;高剪切力组表达差异的microRNAs 有31个(FC>1.5 或<0.5倍,P<0.05),其中25个上调,6个下调。 = = miR⁃21在高剪切力组中上调最显著(FC 0.026),在低剪切力组中显著下调(FC 3.531)。 miR⁃199a在低剪切力组中上调最 = = 显著(FC 0.075),在高剪切力组中显著下调(FC 3.031)。 表达差异的microRNA 的靶基因主要与内皮细胞的力学信号转导、 - 细胞跨膜迁移、钙离子信号通路、细胞内吞作用等相关。 流体剪切力可诱导内皮细胞miR 21和miR⁃199a表达发生改变。 关键词:剪切力;内皮细胞;microRNA;表达 + - - - 中图分类号:Q344 .13    文献标志码:A    文章编号:1672 5565(2016)01 019 07 Effect of fluid shear stress on expression of miR⁃21and miR⁃199a in endothelial cells 1,2,3 3 1∗ 1 1 ZHANG Yan ,WANG Yucai

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