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脉冲序列分析基本思路---NMR-Lab--USTC
E-COSY 生物大分子波谱学原理 吴季辉 E-COSY 生物大分子波谱学原理 吴季辉 双量子谱 生物大分子波谱学原理 吴季辉 双量子谱 生物大分子波谱学原理 吴季辉 脉冲序列基本原则 1、平衡态密度算符:SgIIZ,如15N标记蛋白,gHHZ+gNNZ 2、Delay时期,Hamilton算符为wIIZ + wSSZ + pJIzSz(两核体系),多核体系包括所有的化学位移算符和可能的J耦合算符 3、短的硬脉冲,一般只考虑脉冲所起的作用(90,180…),忽略化学位移和J演化 4、大多成形脉冲可以近似为90/180脉冲 5、Ix/y/z—Ix/y/z?? Ix/y/z—Ix/y/zSx/y/z?? 生物大分子波谱学原理 吴季辉 脉冲序列分析基本思路 1、乘积算符 基本单元:自旋回波,INEPT, COSY, TOCSY,NOESY 2、相干传递途径 从0开始,-1接收 自由进动时相干阶不变,只有脉冲才能改变相干阶 相干传递途径只画出想要的途径 3、相位循环 脉冲相位变化f,则相干阶Dp经历的相位变化为-fDp,即接收相位变化。 若相位循环为360/N,Dp为想要的相干阶变化,则Dp+nN (n=…-3,-2-1,0,1,2,3…)也被选择,其它被抑制 生物大分子波谱学原理 吴季辉 脉冲序列分析基本思路 4、梯度场 可作为z向的脉冲处理 Gz – 180 – Gz:完善180度脉冲 乘积算符z向后,+强梯度:除去所有的非z向相干阶 梯度选择Gz/gS – RevINEPT – Gz/gI: 5、间接维正交检波 States, TPPI,States-TPPI 生物大分子波谱学原理 吴季辉 第六章 同核核磁实验方法 COSY型实验 多量子谱 TOCSY NOESY ROESY 生物大分子波谱学原理 吴季辉 同核核磁谱 生物大分子波谱学原理 吴季辉 同核核磁谱 在记录二维谱或三维谱等之前均需要记录一维氢谱,通常蛋白质溶于水或适当的缓冲液,加5-10%的D2O作为锁场介质。一维氢谱可用于检查样品是否有足够浓度,通常16-32次采样要能得到足够信噪比的谱图,甲基由于快速旋转呈现窄峰,而酰胺质子由于化学交换及14N的标量弛豫呈现宽峰; 一维氢谱还可用于检查样品的共振峰宽是否合理,蛋白质在高浓度下容易聚集从而增宽谱线,严重时甚至1H谱上看不到明显的峰,样品在这种条件下显然无法进行核磁研究;一维氢谱还可用于判别样品的化学位移分布情况,可判别样品是否变性,同时也对研究工作的难度提供一些预测。 蛋白质的一维氢谱一般不应该有非常尖的峰,若出现这种峰,往往是残留的小分子杂质,当然蛋白质的末端及loop区由于分子运动较快也会出现一些较尖的峰。 当样品条件不佳时,一维谱(以及若干信号强的二维谱如1H-15N HSQC)可用来探索适合的样品条件。 生物大分子波谱学原理 吴季辉 同核核磁谱 生物大分子波谱学原理 吴季辉 右图显示ubiquitin(一种蛋白质,76个残基)的一维谱:a 水溶液中,b 箭头所指甲基区的放大,c 8M尿素溶液中,显示变性谱。 生物大分子波谱学原理 吴季辉 生物大分子波谱学原理 吴季辉 生物大分子波谱学原理 吴季辉 生物大分子波谱学原理 吴季辉 COSY型实验 COSY COSY的变型 Relayed COSY 多量子滤波COSY E-COSY 生物大分子波谱学原理 吴季辉 COSY 生物大分子波谱学原理 吴季辉 COSY(correlated spectroscopy),是人们发明的第一种二维谱,同时也是研究蛋白质的最有用的二维谱之一。二个有J偶合的核在COSY上可产生一个交叉峰,由于蛋白质(包括多数其他有机物)中有J偶合意味着这两个核最多通过3个共价键连接,所以COSY谱对于分子结构的拓扑连接可提供非常有价值的信息。 COSY 生物大分子波谱学原理 吴季辉 COSY:脉冲序列分析 生物大分子波谱学原理 吴季辉 第一项为纵向磁化,第二项为多量子项,均不能被观测到; 第三项仍然是第一核的横向磁化,在检测期的频率同演化期类似,均是第一核的,对应于对角峰; 第四项是第二核的反向磁化,在检测期的频率为第二核的化学位移,与演化期不同,对应于交叉峰,这是二维谱最有意义的峰。 COSY:脉冲序列分析 生物大分子波谱学原理 吴季辉 COSY 生物大分子波谱学原理 吴季辉 COSY的交叉峰为反相峰,这一点非常重要,决定了COSY型实验采样及处理时需要注意的问题。而交叉峰与对角峰在相位相差90度,对于谱图在对角线附近的质量有重要的影响。 COSY 生物大分子波谱学原理 吴季辉 F 应用 在高场区由
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