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(精编)蛋白组学:蛋白质相互作用的研究方法.ppt

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姓名:王连连 导师:梁建生 专业:植物学 ; 人类蛋白质组相用; 举世瞩目的基因组计划使大量的新基因不断被发现,然而单纯的基因组DNA序列尚不能解答许多生命问题。基因是相对静态的,而基因编码的产物—蛋白质则是动态的,具有时空性和调节性,是生物功能的主要体现者和执行者。蛋白质的表达水平、存在方式以及相互作用等直接与生物功能相关。 在所有生命活动中,蛋白质之间的相互作用是必不可少的,它是细胞进行一切代谢活动的基础。细胞接受外源或是内源的信号,通过其特有的信号途径,调节其基因的表达,以保持其生物学特性。在这个过程中,蛋白质占有很重要的地位,它可以调控, 介导细胞的许多生物学活性。 ; ;;融合蛋白pull-down实验; 白质相互作用研究领域里得到极大的推广。GST融合蛋白在经过固定有GST(glutathione)的色谱柱时,就可以通过GST 与GSH的相互作用而被吸附。当再有细胞抽提物过柱,就可得到能够与“诱饵”蛋白相互作用的兴趣蛋白。一般来说GST融合蛋白pull-down方法用于两个方面: 一是鉴定与已知融合蛋白相互作用的未知蛋白质 二是鉴定两个已知蛋白质之间是否存在相互作用;洗脱 (2);噬菌体展示;丝状噬菌体; ; 第二个要考虑的问题就是靶蛋白载体或酵母双杂交cDNA文库的构建。一般在编码靶蛋白的基因或cDNA两端加上同源重组序列,然后与靶蛋白载体如pGADT72Rec共同转化靶蛋白酵母菌株如AH109,在酵母同源重组酶的作用下,靶蛋白基因或cDNA序列整合到载体上,完成靶蛋白载体或cDNA文库的构建。最后一步就是筛选文库或直接研究两个蛋白间的相互作用。分别含有诱饵蛋白载体和靶蛋白载体的酵母杂交后,在酵母体内融合表达BD2诱饵和AD2靶蛋白。诱饵蛋白和靶蛋白的相互作用,导致位于侧翼的BD与AD在空间上接近,呈现GAL4转录因子的完全活性,启动下游的报告基因如Ade、His及LacZ等基因的表达,根据报告基因的表达情况,从而达到分离蛋白或研究蛋白互作的目的。 ;; 蛋白质组学的发展促进了多种研究技术的开发和完善,越来越多的技术趋向于大规模、高通量方向发展。同时,物理学、化学、信息学等基础学科研究的发展也大大促进了这些技术的改进。新近发展的计算机分析方法,以基因序列和基因组信息为基础预测蛋白质相互作用,并涉及对参与蛋白质相互作用的表面残基的预测。依赖基因序列来分析蛋白质相互作用的分析方法正在形成。而这些先进的、简易的、大规模分析蛋白质相互作用的技术发展又推动了蛋白质组学的进步。可以预见在不久的将来,随着基因组研究和蛋白质组学的不断深入,生命科学中的种种疑难将被逐一攻破。;谢谢大家!

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