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Dig-Southern检测试验报告2010.10.31
1实验结果报告单
所用试剂、耗材:
北京美莱博医学科技有限公司 北京美莱博医学科技有限公司I内切酶,HindⅢ内切酶: Fermentas(MBI)公司;6×DNA电泳上样缓冲液:北京美莱博医学科技有限公司;
北京美莱博医学科技有限公司;
;10mM dNTP:北京美莱博医学科技有限公司;
DL2000分子量标准:北京美莱博医学科技有限公司;
琼脂糖:西班牙Biowest公司;
AXYGEN耗材:10μl/200μl/1000μl无RNA酶吸头;0.2ml薄壁PCR管;Takara TP600型梯度PCR仪:日本Takara公司;
H1650-W台式微量高速离心机:长沙湘仪离心机仪器有限公司;
超净工作台:北京鑫宏程洁净工程技术有限公司
电泳仪:上海申能博彩生物科技有限公司电泳槽:JY-SP-B型,北京君意东方电泳设备有限公司;
电泳仪:上海申能博彩生物科技有限公司凝胶紫外分析仪:JY02S型,北京君意东方电泳设备有限公司;
移液器:2.5μl/100μl/200μl/1000μl,Eppendorf公司取扩增产物各(l,DL2000分子量标准5(l/泳道。1%琼脂糖凝胶120V电压下电泳25min。用凝胶紫外分析仪观察,照相保存
M:DL2000 1:标记的探针 2:对照
五、基因组DNA酶切
1、酶切体系:
10×buffer: 7ul
EcoRI内切酶: 6ul
样品DNA: 55ul
补足水至 70ul
10×buffer: 7ul
HindⅢ内切酶: 6ul
样品DNA: 55ul
补足水至 70ul
于37℃温箱中酶切20h。
2、电泳
琼脂糖、1%胶浓度、TBE buffer(EB染料电泳后染)
3、电泳结果
M:1KB DNA Ladder; 1:2(EcoRI); 2:2(HindⅢ); 3:7(EcoRI); 4:7(HindⅢ); 5:15(EcoRI); 6:15(HindⅢ);7:17(EcoRI);8:17(HindⅢ); 9:52; 10:52;
11:+CK;
六、转膜
将胶裁成9.5×11.5cm大小,于平皿中用蒸馏水冲洗一次。
加入100ml 0.25 mol/L的盐酸脱嘌呤,室温振荡30 min。再加入变性液(1.5mol/L NaCl、0.5mol/L NaOH)室温振荡30 min。
用蒸馏水冲洗2次。加入中和液(1.5mol/L NaCl、1.0mol/L Tris-Cl , pH7.4)室温振荡2×15min。
用蒸馏水冲洗2次。加入2×SSC平衡凝胶和硝酸纤维素膜5min。
转膜(向上毛细管法,参照《分子克隆》)26小时。取下膜作好标记,在 2×SSC中漂洗一次, UV交联仪上照射固定DNA(5000μJ/cm2)。
取出后标记对应分子量标准位置。
七、杂交
1、预杂交:取11.0ml Hyb高效杂交液(Hyb-100),加入杂交管中,60℃杂交炉中预杂交2h。
探针变性:探针在PCR仪中100℃变性10分钟,立即放冰水浴冷却5min。
杂交:排尽预杂交液,在11.0ml Hyb高效杂交液(Hyb-100)加入6.0μl新变性好的探针,混匀。60℃杂交仪中杂交过夜。
八、洗膜、信号检测(使用美莱博DIGD-110“地高辛杂交检测试剂盒I (化学显色法)” )
1、杂交后室温下,20 ml 2×SSC/0.1%SDS 洗膜2×5min。
2、50℃,20 ml 0.1×SSC/0.1%SDS洗涤2×15min。
3、再将膜置于20ml洗涤缓冲液中平衡2-5min。
4、将膜在10 ml封闭液中封闭30min(在摇床上轻轻摇动)。
5、Anti-Dig-AP 在10000rpm下离心5min。离心后将Anti-Dig-AP用封闭液稀释(1∶5000),2.0μl Anti-Dig-AP加入10 ml封闭液混匀。
6、封闭完成后倒出封闭液,加入稀释好的10 ml抗体溶液,浸膜至少30min。
7、去除抗体溶液,用20 ml洗涤缓冲液缓慢洗膜2次,每次15min。
8、去除洗涤缓冲液,在15 ml检测液中平衡膜2次,每次2min。
9、用检测缓冲液稀释300μl NBT/BCIP化学显色底物,在约15ml新鲜制备的显色液中反应显色。
10、用TE 缓冲液洗涤5 min终止反应,照相记录结果。
九、实验结果:
M:1KB DNA Ladder; 1:2(EcoRI); 2:2(HindⅢ); 3:7(Eco
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