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在quantstudio3d数字pcr系统上对illumina文库进行精确定量
®
应用说明 QuantStudio 3D 数字 PCR 系统
®
在 QuantStudio 3D 数字 PCR 系统上
®
对 Illumina 文库进行精确定量
®
简介 QuantStudio 3D 数字 PCR 芯片包含 20,000 个独立的
® ® ®
Illumina MiSeq 、HiSeq 和 NextSeq™ 500 平台利用
PCR 反应孔,将标准 PCR 反应分成成百上千个单个 PCR
文库克隆的无序固相扩增生成克隆序列簇 (桥式 PCR),
反应。对于诸如典型的 NGS 文库等高浓度样本,事先进
然后进行下一代测 (NGS)。上述簇生成步骤是获得最
行样本稀释有助于确保其中一部分反应含有目标分子,
佳序列数据质量和产量的关键,其主要取决于文库输入
另一部分则不含有目标分子,分别代表阳性和阴性反应。
量 。 目前的 NGS 文库定量检测方法 ( 即 Fragment
在双槽式 PCR 仪上扩增后,利用阴性反应定量样本中的
®
Analyzer™ 、Bioanalyzer 和分光光度计读数) 均无法专
目标分子数,无需参照标准品或对照品。本应用说明介
门检测出同时整合两种文库接头的片段。这常常会导致 ®
绍了一种简单的采用 QuantStudio 3D 数字 PCR 系统进
文库浓度计算错误,从而降低了系统通量。因此,在簇 ®
行 Illumina NGS 文库定量的工作流程。
生成之前,精准的文库定量方法是使测序通量最大化的
®
关键。 Illumina NGS 工作流程中的文库定量
高水平的 NGS 工作流程如
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