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[农学]第五章细胞内蛋白
β型基因 HC5 PSMB1 26489 8.20 RC5 PRS3 + HC7-Ⅰ PSMB2 22836 6.61 RC7-Ⅰ PRE1 + HC10-Ⅱ PSMB3 22931 6.15 RC10-Ⅱ PUP3 + HN3 PSMB4 29192 5.63 RN3 PRE4 + X(MB1,ε) PSMB5 22897 8.67 r x PRE2 + Y(Delta) PSMB6 25315 4.65 γ Delta PRE3 + Z PSMB7 29965 7.61 ? PUP1 + LMP7-E1α PSMB8 29769 5.46 ? ? ? LMP7-E2α PSMB8 30354 7.18 RC1 ? ? LMP2 PSMB9 23245 4.75 γ LMP2 ? ? MECL1 PSMB10 28936 7.73 ? ? ? 人类基因 GDB代号 分子量(Da) 等电点 大鼠基因 酵母基因 对酵母的必要性 α这3对亚基(HC2和Pros30;XAPC7-S和XAPC7-L;LMP7-E1和LMP7-E2)的mRNA是由替代剪接或从不同转录位点起始产生的 蛋白酶体的蛋白水解活性由β亚基负责。成熟的β亚基N-端的Thr-1是蛋白酶体的蛋白水解活性位点。类似于丝氨酸蛋白酶的作用机制,这个Thr-1的羟基对底物进行亲核攻击,它的α-氨基则代替组氨酸咪唑基充当质子受体,而活性部位附近的赖氨酸残基还发挥碱催化作用。蛋白酶体中央大腔的两层β型亚基上七聚环各有3个活性位点,但其催化活性有所不同。已发现20S蛋白酶体具有以下3种不同的催化活性:①胰凝乳蛋白酶样活性,作用于大的疏水残基(如Phe、Trp、Tyr等)的羧基形成的肽键;②胰蛋白酶样活性,作用于碱性氨基酸(如Lys、Arg等)的羧基形成的肽键;③胱天蛋白酶样活性,作用于Glu、Asp这两个酸性氨基酸羧基形成的肽键。在这些活性共同作用之下,靶蛋白很快被水解成有5~15个氨基酸残基的肽段;这些肽段释放到蛋白酶体外侧,再由其它肽酶迅速降解成游离氨基酸。 2.19S调节复合物 为了对蛋白质降解进行精确调控,使蛋白酶体的作用具有高度选择性,20S蛋白酶体必须在ATP存在下与19S调节复合物缔合成26S蛋白酶体。19S调节复合物又称PA700,由18~20种不同的亚基组成,其中6种具有ATPase活性。酵母的6种有ATPase活性的亚基和另外3种亚基形成靠近20S蛋白酶体的基座亚复合物,其余亚基形成距离较远的盖子亚复合物,二者形成“V”字形柔性结构,结合于20S蛋白酶体的两端(图5.7和5.8)。19S调节复合物的主要功能为:① 识别并结合多泛肽化的靶蛋白,已知S5a/Rpn10亚基的C-端有多泛肽链结合部位;② 激活20S蛋白酶体的蛋白酶活性;③ 参与底物蛋白的伸展,使之能进入20S蛋白酶体腔内;④ 切除(Ub)n链并将其降解成Ub单体。 3.11S调节复合物 11S(或PA28)调节复合物由α和β亚基组成,二者交替组成六元环状结构,结合于20S蛋白酶体,在电镜下呈橄榄球状,被称为橄榄球蛋白酶体(football proteasome)。20S蛋白酶体与11S调节复合物的结合使之对多种肽的Km下降,Vmax增大。PA28显著促进蛋白酶体的肽酶活性。 最近发现细胞内有PA700-20S-PA28杂化蛋白酶体,同样具有降解泛肽化蛋白的能力。 介导细胞凋亡的胱天蛋白酶 5.4 介导细胞凋亡的胱天蛋白酶 细胞凋亡(apoptosis)是正常机体细胞在受到生理和病理性刺激后出现的一种自发的死亡过程,它受相关基因的调控,因此又称程序性死亡(programmed cell death),在多细胞生物的组织分化、器官发育以及维持自身稳定中具有重要意义。细胞凋亡一旦失控或发生紊乱,必将导致疾病、畸形甚至死亡。 细胞凋亡与坏死的区别 Necrosis vs. Apoptosis Cellular condensation Membranes remain intact Requires ATP Cell is phagocytosed, no tissue reaction Ladder-like DNA fragmentation In vivo, individual cells appear affected Cellular swelling Membranes are broken ATP is depleted Cell lys
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