蛋白蛋白相互作用界面与非相互作用表面中残基构象优化程度差异的比较.pdfVIP

蛋白一蛋白相互作用界面与非相互作用表面中残基 构象优化程度差异的比较 摘 要 许多蛋白质的功能是通过与其它蛋白的相互作用表现出来的。更多的了 解蛋白一蛋白相互作用界面的特征显得尤为迫切。本文以挑选的55对蛋白为 数据源，研究了蛋白质残基局部骨架构象及局部骨架构象下侧链构象优化程 度定量的方法、蛋白质表面残基局部骨架构象及侧链构象优化程度在蛋白． 蛋白相互作用界面与非相互作用表面之间的差异、单体在形成复合物的过程 中蛋白质表面残基局部骨架构象及侧链构象优化程度的变化以及蛋白一蛋白 相互作用界面与非相互作用表面之间变化趋势的差异。以下是我们得到的结 果： 定量分析了蛋白质残基局部骨架构象及局部骨架构象下侧链构象优化程 度。 从“局部骨架构象下残基类型分布的优化程度在蛋白一蛋白相互作用界面 与非界面间的区别”与“一定残基类型采取的局部骨架构象的优化程度在蛋 白一蛋白相互作用界面与非界面间的区别”以及综合以上两方面的研究结果 可以看出：蛋白质残基局部骨架构象优化程度，蛋白一蛋白相互作用界面有比 非界面更低的倾向性。 蛋白．蛋白相互作用界面残基局部骨架构象下侧链构象优化程度比非相 互作用界面更低是界