蛋白质结构-北京大学化学与分子工程学院-网站首页.pdf

蛋白质结构 ——探询生命秘密的钥匙 北京大学化学与分子工程学院 杨 奕 许文馨 蔡雯倩 江蔚曦 目 录 摘要 一序言 摘 要 本文由蛋白质结构的发现开始，综述了部分不同的蛋白质结构测定方法、蛋白质结构预 测方法并对蛋白质设计的概念进行了描述。 一序言 20世纪末爆发的疯牛病一度使全球所有人人心惶惶，造成如此巨大的影响的疯牛病的起 因究竟是什么呢？经解剖病牛的脑发现，病牛中枢神经系统的脑灰质部分形成海绵状空泡， 脑干灰质两侧呈对称性病变，神经纤维网有中等数量的不连续的卵形和球形空洞，神经细胞 肿胀成气球状，细胞质变窄，另外，还有明显的神经细胞变性及坏死。其致病原称 “朊毒 体”、 “朊病毒”，朊病毒是小团的蛋白质。利用正常细胞中氨基酸排列顺序一致的蛋白进 行复制，是不同于细菌和病毒的生物形式，没有 （不利用）DNA或RNA进行复制，目前并 无针对性治疗。由于其结构简单之特性，朊毒体的复制传播都较细菌、病毒更快。 现在有一种较为生物医学界所同意的猜测是，由于朊病毒自身采用 -折叠结构，从热力 β 学上讲， -折叠较 -螺旋更为稳定，一旦有一个朊蛋白进入牛的脑内，它便会产生诱导效应 β α 使牛的脑蛋白由原来的 -螺旋慢慢变为朊病毒的 -折叠，等到牛脑中的脑蛋白完全变为 -折 α β β 叠后，牛的脑子就变成海绵状体，即感染了疯牛病。这也就解释了为什么疯牛病的潜伏期 [REF] 长。 人们不禁要问，为什么只是蛋白质的折叠形式不一样就会产生如此巨大的差异，那么就 要从蛋白质的结构开始了解了。 二蛋白质结构概述 蛋白质是一类有复杂结构的有机大分子，由氨基酸分子呈线性排列所形成，相邻氨基酸 残基的羧基和氨基通过形成肽键连接在一起。蛋白质的氨基酸序列是由对应基因所编码。除 了遗传密码所编码的20种 “标准”氨基酸，在蛋白质中，某些氨基酸残基还可以被翻译后修 饰而发生化学结构的变化，从而对蛋白质进行激活或调控。多个蛋白质可以一起，往往是通 [REF] 过结合在一起形成稳定的蛋白质复合物，发挥某一特定功能。 由于蛋白质的特殊性，早在18世纪，Antoine Fourcroy和其他一些研究者就已经发现蛋 白质是一类独特的生物分子，他们发现用酸处理一些分子能够使其凝结或絮凝。当时他们注 意到的例子有来自蛋清、血液、血清白蛋白、纤维素和小麦面筋里的蛋白质。荷兰化学家 Gerhardus Johannes Mulder对一般的蛋白质进行元素分析发现几乎所有的蛋白质都有相同的 实验公式。用 “蛋白质”这一名词来描述这类分子是由Mulder 的合作者Jöns Jakob Berzelius 于1838年提出。Mulder 随后鉴定出蛋白质的降解产物，并发现其中含有为氨基酸的亮氨酸， 并且得到了它 （非常接近正确值）的分子量，表明了氨基酸是蛋白质的一种基本组成单位， 并由此最终确定了蛋白质的一级结构。 蛋白质的一级结构是指多肽链的氨基酸残基的排列顺序，包括二硫键的位置，也是蛋白 质最基本的结构。它是由基因上遗传密码的排列顺序所决定的，各种氨基酸按遗传密码的顺 序通过肽键连接起来。每一种蛋白质分子都有自己特有的氨基酸的组成和排列顺序，由这种 氨基酸排列顺序决定它的特定的空间结构，也就是蛋白质的一级结构决定了蛋白质的二级三 级等高级结构。 著名化学家Linus Pauling在195 1年成功地预测了基于氢键的规则蛋白质二级结构，而这 一构想最早是由William Astbury于1933年提出。随后，Walter Kauzman在总结自己对变性的 研究成果和之前Kaj Linderstrom-Lang 的研究工作的基础上，提出了蛋白质折叠是由疏水相互 作用所介导的。至此，蛋白质的二级结构的神秘面纱已经慢慢被揭开了。