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实验操作注意事项要求教材课程.ppt
实验操作注意事项
RNA提取
PCR产物回收
感受态细胞的制备(氯化钙法)
连接
转化
转化菌质粒的提取
RNA提取
提取RNA所用的耗材如枪头、离心管等要用DEPC水浸泡过夜,灭菌时要30min
1)取20ml左右对数生长期的盐藻细胞液(107数量级细胞,太多,细胞裂解不完全,会有DNA,太少,RNA量不足),8000g离心2min(温度不宜太低,否则会产生盐沉淀),弃上清,收集细胞;
2)加入1mlRNATM plus,用移液器吹打重悬,重复混匀至无明显沉底,转入1.5ml离心管中,室温静置5min。注:RNATM plus具有腐蚀作用,并且吸入有害,小心使用。
3)向上述裂解液中加入200ul氯仿,盖紧离心管盖,用手剧烈震荡15s,待溶液充分乳化(无分相现象)后,室温静置5min。(氯仿沸点低,易挥发,振荡时应小心离心管盖突然弹开)
4)12,000g4℃离心15min(此时溶液分为三层,即:上层为透明的水层,RNA溶解在此层中;半固体状的中间层,此层中包含DNA;另外有黄色的有机溶剂下层,蛋白质、多糖等物质溶解在此层),取上清液(约600ul)移入另一新的离心管中(谨慎操作,防止吸入白色中间层)。
5)向上述溶液中加入120ul氯仿,盖紧离心管盖,用手剧烈震荡15s,室温静置5min。(再次抽滤,保证蛋白质的去除)
6)12,000g4℃离心15min,取上清液(约450ul)移入另一新的离心管中。
7)向上清中加入等体积的异丙醇,上下颠倒充分混匀后,于15~30℃下静置10min。
8)12,000g4℃离心10min。离心结束后,试管底部会出现RNA沉淀。
9)弃上清液,缓慢沿管壁加入75%乙醇1ml(用DEPC处理水配制,切勿触及沉淀),轻轻上下颠倒洗涤离心管管壁。
10)12,000g4℃离心5min后小心弃去乙醇。(为避免影响后续操作,应尽量除去乙醇)
11)室温干燥沉淀2~5min(切勿离心或加热干燥,否则RNA将会很难溶解),加入适量的RNase-free水溶解沉淀,待RNA沉淀完全溶解后于-80℃保存。RNA溶解时,很容易降解。最后一步溶解很关键,溶解后需分装
PCR产物回收
准备:75℃水浴;检查Buffer DE-B是否出现沉淀,若出现沉淀,应于70℃温浴加热溶解并冷却至室温后再使用。
1)在紫外灯下切下含有相应DNA片段的琼脂糖凝胶,吸尽凝胶表面液体并切碎。计算凝胶重量(提前记录1.5mL离心管重量),该重量作为一个凝胶体积(100mg=100uL体积)。经验值是小孔是4个孔约为200mg,中孔是3个孔约为200mg,大孔是2个孔约为200mg。
2)加入三个凝胶体积的Buffer DE-A(一般是600ul),混合均匀后于75℃加热,每2-3min混合一次,直至凝胶块完全熔化(熔化不完全会造成阻塞回收柱,DNA片段的回收率低,甚至会收不到目的片段。切胶时尽量切碎)。
感受态细胞的制备(氯化钙法)
准备工作:灭菌:0.1mol/L CaCl2、80%甘油、2个40mlLB液体培养基(250ml锥形瓶,方便摇菌 )、2个5ml液体培养基、一个不含青霉素的LB固体平板、2个40ml离心管、滤纸、5ml枪头
第一天 1)将大肠杆菌DH5α菌株接种于LB固体培养基中,倒置37℃过夜培养(12-16h)。(活化细胞制感受态时,培养基不加抗生素。没有抗生素,细菌长得比较快,可适当缩短培养时间)
第二天 2)用接种环挑取一个DH5α单菌落接种于5mL LB液体培养基中,37℃,190rpm振荡培养过夜。(12h即可)
第三天 (打冰) 3)将1mL菌液全部转接到一个含有40mL LB液体培养基锥形瓶中,37℃,210-250r/min振荡培养2小时。
4)将菌液转移到40mL离心管中,冰上放置10min以抑制菌生长。(此时打开离心机预冷,将0.1mol/L CaCl2、80%甘油放在冰上预冷) 4℃,4000 r/min离心10min,回收细胞。倒出培养液,将管倒置在灭菌滤纸上1min,以便使培养液流尽
5)加入预冷的0.1mol/L CaCl2 10mL悬浮沉淀(轻轻吹打,使菌液均匀),立即放在冰上保温30min,使其低渗。4℃ 4 000r/min离心10min,回收细胞。
6)用冰冷的0.1mol/L CaCl2 2mL悬浮细胞(务必放冰上)。
7)分装细胞,每200μL感受态细胞一份,并分别加入终浓度10-15%甘油,-80℃贮存。
连接
10uL的反应体系:
pMD18-T Vector(取出放置冰上)1uL
回收的PCR产物 4uL
SolutionΙ 5u
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