利用srap分析核盘菌遗传多样性-生物多样性.pdf

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利用srap分析核盘菌遗传多样性-生物多样性

生物多样性 2010, 18 (5): 509–515 Biodiversity Science http: // 利用SRAP分析核盘菌遗传多样性 1 1 2 3 1* 陈碧云 胡 琼 Christina Dixelius 李国庆 伍晓明 1 ( 中国农业科学院油料作物研究所, 农业部油料作物生物学重点开放实验室, 武汉 430062) 2 (Swedish University of Agricultural Sciences, Box 7080, 75007 Uppsala, Sweden) 3 (华中农业大学, 武汉 430070) 摘要: 核盘菌(Sclerotinia sclerotiorum)是危害油菜等多种经济作物的重要病原真菌。研究不同地区、相同或不同寄 主核盘菌的遗传多样性对了解核盘菌的遗传演化过程和指导病害防控具有重要意义。我们采用序列相关扩增多态 性(sequence-related amplified polymorphism, SRAP)标记对不同地理来源、不同寄主来源的76个核盘菌菌株的遗传 多样性进行了分析。7对SRAP引物共获得260个位点, 其中114个为多态位点, 占43.85% 。UPGMA聚类结果显示, 在相似性系数为0.64时, 76个核盘菌菌株分为4个组, 每组包含的菌株数分别为54、18、2和2 。聚类及主成分分析 结果显示, 来源于春油菜生态区和冬油菜生态区油菜上的核盘菌菌株可以明显分为两簇, 而油菜、大豆、莴苣等 不同寄主植物上的核盘菌菌株没有明显的遗传分化。分子变异分析(AMOVA)结果显示, 不同地理来源、不同油菜 生态区和不同寄主来源的核盘菌群体内的变异率分别为75.2% 、81.2%和97.6%, 均达到极显著水平(P0.001); 不 同地理来源和不同油菜生态区的核盘菌群体间的变异率分别为24.8%和18.8%, 也达到极显著水平(P0.001); 不同 寄主来源的核盘菌群体间的变异率仅为2.4%, 变异不显著(P = 0.8673) 。研究结果表明, 来源于春油菜生态区的核 盘菌的遗传多样性高于冬油菜生态区。 关键词: Sclerotinia sclerotiorum, 油菜, SRAP标记, 遗传变异, 遗传分化 Genetic diversity in Sclerotinia sclerotiorum assessed with SRAP markers 1 1 2 3 1* Biyun Chen , Qiong Hu , Christina Dixelius , Guoqing Li , Xiaoming Wu 1 Oil Crops Research Institute of Chinese Academy of Agricultural Sciences, Key Laboratory of Oil Crop Biology of the Ministry of Agriculture , Wuhan 430062

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