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基于网格的分布式数据计算预测蛋白质相互作用关系 谢江1’2张武1’2梅健1 (上海大学计算机工程与科学学院 上海200072)1(上海大学系统生物技术研究所 上海200444)2 摘要随着不同物种蛋白质相互作用关系数据的大量积累，蛋白质相互作用特别是大规模蛋白质相互作用的研究成 为生命科学领域的又一个研究热点。目前互联网上存在大量分布式的、异构的蛋白质相互作用关系数据源，用户难以高 效地整合这些数据源中的信息。本文针对多个大容量的蛋白质相互作用关系数据库，在数据网格BD-Grid环境下，提出 了预测蛋白质相互作用关系通用结构框架，通过有效的元数据管理服务和合理的数据分类服务，屏蔽异构数据库间的差 异，实现了用户对数据的透明存取，并在该数据平台上，实现了预测蛋白质相互作用关系的应用，使相关领域的研究人员 能以生物信息学的方法研究蛋白质的相互作用关系。初步的实验结果说明，该Ⅸ×Ⅻd具有较好的性能。 关键词数据网格，分布式异构数据，蛋白质相互作用关系，生物信息学 OilDataGrid