学院电子学研究所生物芯片技术简介.ppt

生物芯片技术简介 赵 湛 中国科学院电子学研究所 主要内容 生物芯片概念 生物芯片的种类型 生物芯片的设计及制备方法 国际国内发展情况 什么是生物芯片？ 类比分析： 晶体管——集成电路——计算机芯片 生物芯片——计算机芯片 计算机芯片——电子信息 生物芯片——生物分子携带的信息 定义：生物芯片是一种可以快速地、高通量（并行）地处理生物信息的器件。 生物芯片的发展历史 很短——随着基因组计划而发展起来的 基因测序 很长——基础是生物传感器的发展 分子识别 生物芯片概念 生物芯片是近年来在生命科学领域中迅速发展起来的一项高新技术，它主要是指通过微加工技术和微电子技术在固体基片表面构建的微型生物化学分析系统，以实现对细胞、蛋白质、DNA 以及其他生物组分的准确、快速、大信息量的检测。 生物芯片的主要特点是高通量、微型化和自动化。芯片上集成的成千上万的密集排列的分子微阵列，能够在短时间内分析大量的生物分子，使人们快速准确地获取样品中的生物信息，效率是传统检测手段的成百上千倍。 研究意义 生物芯片将是继大规模集成电路之后的又一次具有深远意义的科学技术革命； 集成电路对改善我们的生活产生了巨大的影响，生物芯片将对保护我们的生命起重要的作用。 研究意义 生物芯片的分类 生物芯片的分类 按制作方法分类 点阵型生物芯片 原理：分子识别 方法：生物传感器平面集成 结构：阵列形分布 点阵型生物芯片生物芯片与生物传感器 生物传感器原理 两部分组成： 分子识别膜 酶反应 抗原抗体 核酸 换能器 电流、电位电极 场效应晶体管 压电晶体 光纤 SPR 点阵型生物芯片生物传感器 光纤生物传感器 点阵型生物芯片DNA探针(基因片断）概念 Probe: capture; reporter 生物芯片－生物传感器集成 光纤生物传感器集成 点阵型生物芯片 所谓点阵生物芯片就是将大量的探针（基因片段），有序地、高密度地排列在面积不大的以玻璃、硅以及硝酸纤维膜等为载体（或称基片）的表面上； 所排列得基因片断是已知碱基序列并且是固定于一定位置的可寻址的识别分子，当被测的分子与识别分子（探针）在一定的反应体系内发生杂交反应； 反应结果可用同位素法、化学荧光法、化学发光法或酶标法显示，然后用精密的扫描仪或CCD摄像技术记录； 通过计算机软件分析，综合成可读的生物信息。可以达到快速、准确、高效地分析生物信息的目的。 点阵芯片的制作技术（1） 点样法 点接触法 喷墨法 … 原位合成法 光刻合成法 分子印章法 … … 点阵芯片的制作技术（2） 点接触法 特点：实验样机容易做，是一种快速、经济的仪器，可以在3.6cm2面积上点1万个cDNA 每个样品都必须是经过纯化合成好的。 点阵芯片的制作技术（3） 喷墨法 特点：通过压电晶体或其他推进形式把生物样品喷射到载体上，1cm2可以喷射1万个点，为非接触式； 每个样品都必须是经过纯化合成好的。 点阵芯片的制作技术（4） 光刻DNA合成法 特点：微电子中的光刻工艺与DNA的化学合成方法相结合，合成密度高，在1.6cm2的面积上能合成40万组寡核苷酸； 缺点：成本高。 点阵芯片的制作技术（5） 分子印章法 东南大学发明 高密度 点阵芯片的制作技术（6） 点阵芯片的制作技术（6） μ- Stamp PIXSYSTMPA系统容量匹升（10-12）级生物芯片点样系统 全自动针型阵列（pin array）点样系统，非常适用于基因组研究中制备高密生物芯片组 高精度点样可达2500点/cm2 点样量范围宽，可达100到500微微升 极短的程序运行周期，32个样品片仅需80秒即可完成从浸样、点样到冲洗全过程 可一次处理50个样品片或8个微孔板 生物芯片的应用 基因表达 药物筛选 疾病诊断 农作物育种和改良 生物武器 司法鉴定 食品卫生监督 … … DNA点阵芯片 蛋白质点阵生物芯片 主动点阵芯片 LOC生物芯片简介 BioMEMS, LOC, μTAS LOC制造技术（1） 实现LOC的技术是 MEMS LOC制造技术（2） LOC制造技术（4） MEMS的设计方法 LOC制造技术（5） MEMS的设计方法 LOC制造技术（6） MEMS制造技术 芯片实验室的研究路线 单一功能的LOC芯片(元件） 微反应器：DNA扩增聚合酶链反应（PCR）芯片 微流体器件：毛细管电泳（CE）芯片 微泵、微阀 微传感器 集成LOC PCR芯片（1） PCR扩增原理 PCR-Polymerase Chain Reaction DNA扩增－DNA放大（amplification) PCR芯片（2） PCR扩增原理三个步骤： 高温变性（90 oC以上） 低温退火（37 oC ～55 oC） 中温延伸（70 oC左右） PCR芯片国内外研究概况（1） P