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赵洋 工程师zhaoyang@nscc-tj.gov.cn国家超级计算天津中心
高性能计算平台 大规模硬件设施 基于“天河一号”,提供万 核量级大规模科学计算 自主研发的高速互联通信网络 良好的软件资源 编译、开发、科学计算软件、 工程仿真软件等 高速的网络接入 目前使用联通和电信100M光纤接入, 用户的访问速度M量级 大规模科学计算环境建设 */22 Thank you 这个曲线代表了近30年来,超级计算机发展的一个缩影。1976年美国克雷公司研发出第一台商用巨型机,它每秒钟可以进行1.6亿次的浮点运算。到1998年已经达到一万亿次的浮点计算能力,2009年的同样是cray公司生产的jaguar超级计算机,他已经达到每秒钟千万亿次的运算级别。 亿-万亿-千万亿 Cray公司,数据为Linpack实测最大值 随之超级计算机计算能力的高速发展,以下三个问题也逐渐凸显:由于系统规模越来越大,系统功耗越来越高,提高相应的冷却系统,如何降低功耗是在设计超级计算机时重要考虑的问题之一;由于有成千上万个节点,需要良好的通信系统,如何提高节点的稳定性,节点坏时如何快速稳定地切换到其他可用节点。 Cray-YMP,1988年,8个向量处理器 ,2.3Gflops Cray T3D,1993年,128处理器(alpha),19Gflops Cray T3E,1997年,512处理器,307Gflops Cray T3E-1200,1998年,1080处理器,1296Gflops 1、1950年,IBM总裁(president)预言,全世界只要大约6台电子计算机 2、1977年,Seymour Cray称Cray-1全世界也就大约100台潜在用户 3、1980年,Cray-1市场已获得相当成功,IBM一项研究结论是,Cray类型的系统,每年只会有50套左右的市场。这一研究导致IBM较晚进入巨型机市场1、1950年,IBM总裁(president)预言,全世界只要大约6台电子计算机 1图:全尺寸飞行器跨流域飞行模拟。①随着核数增加到万核,实际加速比的曲线一直表现出较好的线性,说明这个应用在天河上有很好的可扩展性和加速比。 2图:全球海洋海冰的模拟 3图:这个图是浙大、北大、中科大合作开发的GTC程序,每秒钟粒子模拟的步数,在千核以内,表现出很好的超线性加速。蓝色为。。。 4图:生物医药领域的生物大分子动力学模拟的研究。在原子与分子水平上研究蛋白质的结构与功能的关系。横坐标为使用核数 ,纵坐标为加速比,可拿一个数据分析下。 联想集团的Deepcomp深腾 万核应用的挑战:系统通信问题,节点稳定性问题;I/O问题 讲完异构结构后,讲具体有多少CPU和GPU 2010年11月,top500推出的全球前500超级计算机排名中,天河一号排名第一的证书。 Cabinet机柜 这个图是对天河一号的硬件环境的一个说明 一个机柜64个节点 天河一号分为5个子系统 登陆节点,在上边提交作业,编译程序,编译好程序后,会把编译后的二进制代码可执行文件放到计算节点,进行运算。 服务节点: FT-1000八核处理器是国防科大自主研发的。 异构并行编程就是要协同。。。 天河一号异构架构在测试中得到验证 Linux操作系统、slurm作业调度系统、lustre集群文件系统 讲完编程方法后,具体来讲可以看下页图例 GPU的设计目标与GPU是不同的,CPU的大部分晶体管主要用于构建控制电路和Cache,只有少部分的晶体管完成实际的运算工作;而GPU架构中,其控制电路相对简单,而且对Cache的需求较小,所以大部分晶体管可以组成各类专用电路和多条流水线,使GPU的计算速度有了突破性飞跃,拥有强大的浮点运算能力。 首先看下天河一号的用户数量分布图,所占份额前三位的分别是基础科学研究37%、。。。 科研用户还是占大多数 天河一号资源使用分布图 公司企业使用的资源量占绝大多数 以磁约束聚变研究为例说明天河一号的应用实践, ITER-CN:国家磁约束聚变大规模数值模拟与科学计算发展计划 等离子体在磁场中的运动模拟 基于国家这个发展计划,超算中心与浙大、北大、中科大聚变中心联合开发的GTC GPU版本程序。。。 与美国能源部jaguar系统做了对比。 可视化结果 在实际进行处理时,。。。 electron模块占了整个程序运行时间的70%左右,对该模块进一步热点分析,发现pushe和shifte这两部分耗时最多。因此我们把这两个部分放在GPU中执行,进行加速。同时,在GPU中,我们也进行了优化操作。 PUSHE takes about 60-70% of the total time SHIFTE takes about 15-20% of the total time 下图反映了在使用GPU加速后的运行时间,pu
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