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uniprot数据库检索及数据条目注释信息-abc
实用生物信息技术课程第 3 次作业
UniProt 数据库检索及数据条目注释信息
姓名 陈耿佳 学号 1301214752 组号 G01C
1. UniProt 蛋白质序列数据库
1) 参阅 Swiss-Prot 和 TrEMBL 统计报表（Release Statistics ），列表说明这两个子库的
总数据量，以及不同蛋白质证据（Protein Existence ）的数据条目数。
数据库 Swiss-Prot TrEMBL
总数据量 545388 100% 100%
蛋白水平证据 82702 15.2% 26770 0.05%
转录水平证据 62490 11.5% 854251 1.53%
同源预测 382436 70.1% 25.57%
其他预测 15871 2.9% 72.86%
不确定 1889 0.3% 0 0.00%
2) 列表说明 Swiss-Prot 和 TrEMBL 中数据条目数列前 10 位的物种，包括中文名、英
文名和拉丁文学名。
Swiss-Prot：
排名 条目数 中文名 英文名 拉丁文学名
1 20264 人类 Human Homo sapiens
2 16669 小鼠 Mouse Mus musculus
3 12851 拟南芥 Mouse-ear cress Arabidopsis thaliana
4 7897 大鼠 Rat Rattus norvegicus
5 6621 酿酒酵母 Bakers yeast Saccharomyces cerevisiae
(strain ATCC 204508 / S288c)
6 5984 家牛 Bovine Bos taurus
7 5103 裂殖酵母 Fission yeast Schizosaccharomyces pombe
(strain 972 / ATCC 24843)
8 4431 大肠杆菌 Colibacillus Escherichia coli (strain K12)
9 4185 枯草杆菌
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