基因组学讲课演示教学.ppt

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DNA甲基化为正常发育所必需。正常细胞中DNA甲基化的功能包括转座因子的沉默、病毒序列的失活、染色体完整性的维持、X染色体失活、基因组印记及大量基因的转录调节等。一些研究还发现随着个体年龄的不同,DNA甲基化水平存在差异,提示个体的发育和衰老过程与DNA甲基化相关 DNA甲基化特点: 可遗传的,即这类改变通过有丝分裂或减数分裂能在细胞或个体世代间遗传;(表观遗传学) 是基因表达的改变; 没有DNA序列的变化,或不能用DNA序列变化来解释。 在DNA去甲基化酶的作用下可以去甲基化,即具有可逆性。 (二)、基因突变 定义:是由于DNA分子中发生碱基对的增添、缺失或替换,而引起的基因结构的改变。 从分子水平上看,基因突变是指基因在结构上发生碱基对组成或排列顺序的改变。基因虽然十分稳定,能在细胞分裂时精确地复制自己,但这种稳定性是相对的。在一定的条件下基因也可以从原来的存在形式突然改变成另一种新的存在形式,就是在一个位点上,突然出现了一个新基因,代替了原有基因,这个基因叫做突变基因。于是后代的表现中也就突然地出现祖先从未有的新性状。 基因突变的性质 (1)普遍性 (2)随机性 (3)稀有性 (4)可逆性 (5)少利多害性 (6)不定向性 (7)有益性 (8)独立性 (9)重演性 基因突变的种类 (1)碱基置换突变 : 转换和颠换 (2)移码突变 (3)缺失突变 (4)插入突变 基因突变在我们实际生活当中也有一定的应用,比如诱变育种,害虫防治等。 (三)另外两种新碱基 DNA碱基组成是各种生物一个稳定的特征,这种组成不受年(菌)龄以及突变因素以外的外界条件的影响,即使个别基因突变,碱基组成也不会发生明显变化。一般认为DNA分子含有四种碱基:腺嘌呤(A)、鸟嘌呤(G)、胞嘧啶(C)和胸腺嘧啶(T)。近几年,有人将表观遗传学修饰——5-甲基胞嘧啶称为第5种碱基,5-羟甲基胞嘧啶(5-hmC)称为第6种碱基。 研究人员在人体胚胎干细胞和实验老鼠器官染色体组中发现了两种新型的DNA碱基:5fC(5-甲酰胞嘧啶)和5caC(5-羧基胞嘧啶),改变了原有认为DNA碱基只有4种(近期增加至6种)的观点,这对于干细胞和癌症的研究具有重要意义。这两种碱基实际上都是由胞嘧啶经由张毅教授研究组一直研究的关键蛋白:Tet蛋白修饰后形成。 这一研究成果公布在Science杂志上。 张毅教授,这位华人科学家曾入选2008年Science Watch选出的高影响力论文的数量最多的研究人员,他是分子生物学和遗传学领域高影响力论文的数量最多前十位顶级科学家之一,发表了多篇Nature,Science,Cell等顶级杂志文章,是一位高产高效的科学家。 染色质和DNA修饰 韩兰春 2013年11月28日 主要内容 1、染色质,DNA的概念 2、组蛋白修饰种类及对基因表达的影响 3、DNA修饰种类及对表达的影响 4、染色质重构 回顾知识 染色质(chromatin)最早是1879年Flemming提出的用以描述核中染色后强烈着色的物质。 现在认为染色质是细胞间期细胞核内能被碱性染料染色的物质。染色质的基本化学成分为脱氧核糖核酸核蛋白,它是由DNA、组蛋白、非组蛋白和少量RNA组成的复合物。 根据着色的深浅染色质有常染色质和异染色质之分 DNA:即脱氧核糖核酸,是一种长链聚合物,组成单位称为四种脱氧核苷酸,也叫碱基。DNA是染色体的主要化学成分。DNA是一种分子,可组成遗传指令,以引导生物发育与生命机能运作。带有遗传信息的DNA片段称为基因。 常染色质与异染色质 1. 常染色质:基因表达活跃的区域,染色体结构较为疏松 2. 异染色质:基因表达沉默的区域,染色体结构致密 核小体 常染色质 异染色质 常规的染色质修饰 染色质化学修饰的类型 染色质化学修饰是指对染色质的组成成分,如DNA、RNA、组蛋白、非组蛋白进行化学基团的添加或去除的反应过程。 常见的染色质化学修饰方式有:甲基化-去甲基化,乙酰化-去乙酰,磷酸化去磷酸。除此之外,还包括泛素化ADP-核糖基化和二硫键形成等修饰方式。染色质中的组蛋白和DNA成分是最主要的化学修饰底物。目前,已在细胞中发现了一系列的染色质修饰酶类,这些酶不仅具有高度的位点特异性,而且对底物原有的修饰状态也有选择性。组蛋白的化学修饰位点通常位于其N-端或C-端尾区,极少数情况下(如H3-K79)位于内部;有些位点可发生双修饰反应;相邻位点的磷酸化修饰与甲基化修饰可能相互干扰 染色质中的组蛋白和D

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