核基因转录及加工培训讲解.pptVIP

1.染色质水平调节 主要依赖于辅助调节因子对染色质结构进行修饰。辅助调节子通过三种方式对染色质结构起调节作用： 1）依赖于ATP 的核小体重建复合体（ADRC）：它们依靠水解ATP 所产生的能量来改变核小体的相对位置，将DNA 序列暴露出来，使转录因子能够与之结合。这是一个物理过程，染色质本身的结构并没有变化，只改变核小体的相对位置。 2）组蛋白修饰：主要通过共价修饰组蛋白的末端来改变染色质结构。当构成染色质的组蛋白发生修饰时，就会影响染色质的构型，而结构的变化引起基因转录活性的变化。 3）DNA甲基化：真核DNA约有5%的胞嘧啶被甲基化。一般而言，DNA甲基化抑制基因表达。 组蛋白发生修饰，碱基暴露等原因而引起核小体结构改变，使核小体不稳定性增加。 Sequence-independent linker histones: control DNA compaction and accessibility to trans-acting factors post-translational modifications of histone tails: control compaction of DNA and serve as docking sites for trans-acting factors DNA甲基化对基因转录的抑制作用 甲基化预测 在我们的基因组中，发生甲基化的DNA影响基因的开关。基因表达能够推断与我们的身份相关联的几种属性，如性别、种族、年龄和健康，甚至童年时代经历。 Factors underlying variable DNA methylation in a human community cohort. Lucia L. Lama, et al. doi: 10.1073/pnas.1121249109 2.DNA水平的调节 真核基因一般都处于阻遏状态，RNA聚合酶对启动子的亲和力很低。 通过利用各种转录因子正性激活RNA聚合酶是真核基因调控的主要机制。 3.RNA水平的调节 转录后加工：真核基因大多为断裂基因，内含子和外显子一起被转录。转录后产物经剪接（包括可变剪切,alternative splicing）、加帽、加尾等加工修饰，才能转变为成熟的mRNA 。 RNA降解：包括非特异性降解（RNase, exosome)和特异性降解(NMD，RNAi)。 4.蛋白水平的调节 蛋白质合成:ribosome蛋白翻译，构像折叠，细胞内定位 蛋白质修饰:包括磷酸化(phosphorylation),乙酰化(acetylation)，甲基化(methylation),糖基化(glycosylation),etc 蛋白降解：包括非特异性降解（protease, peroxisome， vacuole)和特异性降解(Ubiquitin/proteasome system,下下次课具体讲)。 真核基因表达调控的主要步骤 染色质 去组装 蛋白质修饰 生化功能 真核基因转录后的加工 1.真核基因转录产物的特点： 含内含子，需经剪接去除； 需要修饰（加帽、加尾，稀有碱基）； 转录和翻译是两个相对独立的过程。 2.加工类型: 加帽、加尾 修饰——甲基化、酰基化 剪接 RNA编辑 RNA加工的意义： 活化——使无活性的前体RNA加工成有活性的成熟RNA；（rRNA、tRNA的剪接、修饰） 改变基因的编码产物——同一转录产物，不同剪接方式，编辑方式，蛋白产物不同； 调节方式——加工会影响RNA的活性、半衰期、运输等，影响RNA功能的发挥； 编码蛋白质的结构基因在核浆中被转录，RNA分子很大，且很不稳定，由于大小很不一致，称为核内不均一RNA（hnRNA），其中mRNA是由hnRNA加工成的。 hnRNA 25%——mRNA 75%——在核内降解 hnRNA先加帽， hnRNA尾端被切去一段后，加poly（A）尾，切除内含子成为mRNA，进入细胞浆内。 加帽 ( Cap0、CapI、CapII三种帽子结构 ) 在细胞核中进行，hnRNA的5’端常为GTP， 帽子化过程后，形成m7G5’ppp5’Np结构。 5’帽子的功能： 保护mRNA免受5’-核酸外切酶降解； 使mRNA进入细胞质； 对翻译起识别作用（ m7G5’ppp5’Np 优先与 核糖体结合）。