基于GPU的高性能计算系统修购项目技术需求.docVIP

第  PAGE 11 页 共  NUMPAGES 11 页 2016年“基于GPU的高性能计算系统”修购项目技术需求 项目介绍 仪器设备申请单位成立的联合研究中心和开放研究平台目前支撑大量与微生物、动植物及人类相关的基因组学和生物信息学分析项目，在基因组科学及生物信息学研究领域承担着多项国家、省部级和中科院重大科研任务，包括973课题“肿瘤异质性演化机制与个体治疗策略的生物学研究”、“禽流感病毒遗传变异分析”、863课题“肿瘤的个体化RNA干扰治疗”、“长非编码RNA的系统识别与鉴定关键技术研发”、国家重大研究计划“蛋白质组海量质谱数据的解析及其在人类基因组注释中的应用”、基金委重大项目“微进化过程的多基因作用机制-非模式生物基因组遗传变异的识别算法和计算平台的建立”、中科院先导项目“动物复杂性状的进化解析与调控”、中科院重点部署项目“肿瘤微进化和第二代肿瘤基因组学”等，在研究内容上多涉及到海量数据的处理和多组学数据的整合分析，均依赖于大规模的数据分析和并行计算，使人们能够更深入的理解单组学数据未能发现的生物学问题。平台现有的以CPU构架为基础的超算服务器尚不能满足当前研究内容及预期发展的需求。我们需要构建基于GPU的服务器及IB（或万兆）网络组成的计算系统，配置GPU和CPU，同时在存储方面增加配套设备，以补充现有设备不足。 随着“人类疾病和资源动植物基因组研究平台”、“单细胞基因组研究平台”建设的逐步推进，平台已初步具备从高通量测序数据产生、高通量单细胞分选和高通量数据分析的能力，并将在“十二五”的建设基础上，继续加快肿瘤基因组等重大疾病和资源动植物基因组序列分析平台的建设。针对这些需要，本平台已将部分老旧型号的Hisq2000测序仪进行了升级，并购置了其它型号的测序设备与之形成互补搭配。升级后的每套设备单次运行就会产生600Gb以上的测序数据，每年将产生百Tb级的数据。测序能力的提升也对平台的计算能力提出了新的要求。为进一步提升高通量基因组分析水平，加强单细胞水平基因组、表观遗传组、转录组和蛋白质组、代谢组等多组学整合分析能力，满足该领域相关研究日益增强的服务支撑需要，也需要添置新型的以GPU构架为基础的大型运算系统。 本项目资金来源于中国科学院科学事业单位修缮购置专项资金，专门用于购置基于GPU的高性能计算系统。预算金额200万元整。所要达到的目标前景：CPU和GPU总聚合浮点运算能力不低于30Tflops,存储裸容量不少于200TB，并提供完整的系统解决方案，满足交付即可用原则。 采购产品一览表 序号货物名称是否为主要产品（主要产品须提供厂家唯一授权）单位数量产地（国产/进口）刀片服务器是台20国产GPU服务器是台4国产管理服务器是台1国产并行存储系统是套1国产 机柜系统否套2国产项目履约时间、地点 履约时间：所有产品交货日期为合同签定之日起 30天内。 履约地点：北京市朝阳区北辰西路1号院2号遗传发育所1号楼307 现场踏勘：否 采购人信息 单位名称：中国科学院遗传与发育生物学研究所 单位地址：北京市朝阳区北辰西路1号院2号 联系人姓名：汪林 联系电话电子邮箱：linwang@genetics.ac.cn 产品清单及指标要求 重要性分为“★”、“#”和一般无标示指标。★代表最关键指标，不满足该指标项将导致投标被拒绝，#代表重要指标，无标识则表示一般指标项。 （一）产品指标要求 刀片计算节点 序号重要性指标项指标要求基本参数★服务器外形刀片式刀片箱数量根据刀片总数配置所需刀片箱的数量#刀片箱电源及风扇电源支持N+N或N+1冗余，保证有电源故障时所有刀片及所有内部配件不能宕机；配置冗余的风扇模块，实现风扇热插拔；满配电源和风扇。#刀片箱以太网交换模块配置配置万兆以太网交换模块，对内每节点达到万兆速率，对外≥2个万兆以太网端口。#管理模块集成管理模块，可实现与操作系统无关的远程对服务器的完全控制，包括:虚拟电源可远程开机、重启、关机；更新Firmware；虚拟控制台可远程监控图形界面，可远程从本地软盘和光盘或其影像启动安装、操作Windows, Linux等软件；远程虚拟KVM，虚拟介质（虚拟介质：虚拟软驱、虚拟光驱），支持和管理软件集成；监控系统可实时监测内部主要部件的状态，包含CPU、内存、风扇、电源、温度等信息。★刀片服务器数量≥20台双路刀片服务器★刀片服务器CPU每