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科学的数字化革命
科学的数字化革命
2
0世纪90年代中后期,当电子商务和电子政务之风开始席卷全球的时候,
英国科学技术办公室主任泰勒 (JohnTaylor)于1999年首先提出了电子科学
① 主要是指利用信息技术帮助那些计算强度很高、使用海
(EScience)的概念,
量数据集、在高度分布的网络环境下进行研究的科学学科的发展,例如粒子物理
学、生物信息学、地球科学、社会仿真等。这些学科在很大程度上仰赖于高端计
算机和软件进行科学探索和发现。在EScience计划的推动下,英国投入了大量
的资金 (约234亿英镑),用于科学研究用的信息基础设施建设。美国则由国
家科学基金和能源部在计算基础设施 (CyberInfrastructure)的名下定义E
② 进行科研信息基础设施建设,但范围拓宽为支持包括数据获取、
Science项目,
存储、管理、集成、挖掘、可视化,以及在互联网上进行的各种先进的计算和信息
处理服务。2007年,美国国家科学基金发表了 《面向21世纪的计算基础设施报
告》,比较全面地介绍了美国的观点、目标、战略、计划和做法,很有参考价值。
EScience是着眼于利用先进的信息和网络通信技术向科学家们提供进行新探
索、新研究、新发现的新方法和新工具。然而,科学探索、研究和发现本身是不可
能自动化的,起着核心作用的还是科学家本人。于是EScience转向探讨以什么样
的手段和方式,向科学家提供以支持科学研究为目的的新范式(paradigm)。
2008年,美国马里兰大学的施耐德曼 (BenShneiderman)在Web20问
③ 主张将现有的研究模
世的影响下,提出了科学20(Science20)的倡议,
式(Science10),即 “独立研究-发表文章”的模式,改造为与Web20相匹
配的模式,即利用博客、社交网络、维基 (Wiki)网站、计算机网络、互联网
及视频期刊等各种手段,在研究阶段即共享数据、共享思路、共享方法,实现科
学合作、成果网上发布等。这种愿望是良好的,但显然是不切合实际的。因为,
Science20无法解决成果的署名权、所有权和知识产权等问题。Science20虽
然也因此行之不远,却促进了关于信息时代科学研究的开放性的讨论。
ttp://enwikipediaorg/wiki/E-Science.
① h
② http://enwikipediaorg/wiki/Cyberinfrastructure.
③ http://enwikipediaorg/wiki/Science_20.
033
①
过去十年,中国的科研信息化有了很大的发展。 在EScience的影响下,
中国科研信息化的基础设施,特别是在计算和数据密集型的学科领域,有了较
大的发展。比如,紫金山天文台在南京、洪河、姚安搭建了三套高性能计算集
群,研发了高阶精度的宇宙多相流体动力学的数值模拟程序WIDGEON;上海
生命科学研究院建设了高性能计算生物学信息处理平台,开发了先进、高效的
生物数学模型和计算算法;兰州大学、清华大学、中科院计算所在计算化学网
格应用系统的基础上,开展了禽流感病毒H5N1药物的大规模虚拟筛选的示范
应用研究;等等。在科技数据资源整合与共享方面,中科院大力推进全院重要
领域及优势领域积累数据资源,形成了一批直接服务于科技创新的数据库。截
至2012年底,8150%的院属单位建立了面向本学科领域或项目的协同工作环
境,9490%的单位拥有了自建科学数据库,9278%的单位拥有了知识库管理
系统,各研究所的高性能计算环境CPU平均利用率达到了7302%。
然而,在信息时代来临的大背景下,在科学技术领域,信息化仅仅着眼于
创建有利于学科发展和创新的信息化环境是不够的。当代的信息革命起源于一
系列科学和技术革命所引起的生产力的巨大变革和发展,也一定会反过来引发
新一轮的科学革命和技术革命。这一点现
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