合成生物学研究与进展教程.ppt

与合成生物学相关的主要网站 / / /Main_Page /portal/index.html / / iGEM国际遗传工程的机器设计竞赛 (International Genetically Engineered Machine Competition ) 国际遗传工程的机器设计竞赛始于2005年，每年由麻省理工学院主办，是合成生物学领域的国际性学术竞赛。每支队伍尝试使用标准化后的生物模块元件库，利用标准化的基因工程方法，以特定目的拼装人工生物系统，并进行操纵和测量。 ( /wiki/index.php/Main_Page ) ( /Main_Page ) 发表合成生物学较多的刊物及新创刊的刊物 PNAS Nature Science MSB 合成生物学研究与进展 合成生物学（synthetic biology） 一、合成生物学的定义 二、合成生物学的产生 三、合成生物学的研究内容 四、合成生物学的研究方法 五、合成生物系统的设计 六、合成生物学的应用领域 七、合成生物学在藻类中的应用 八、研究意义及思考 九、自己的想法 一、合成生物学的定义 合成生物学网站是这样介绍的：合成生物学包括两重意义 a、新的生物部件（part）、装置（device）和系 统（system）的设计与构建 。 b、对现有的天然存在的生物系统的重新设计以 造福人类社会。 (http：///) 1. 合成生物学一词最早出现在1911年The Lancet 杂志。 2. 2003年HGP (Human Genome Project )。 3. 2004年美国MIT出版的《Technology Review》把 合成生物学选为将改变世界的十大技术之一。 4. 2009年12月《自然·生物技术》出版了“Focus on Synthetic Biology”的合成生物学专辑。 5. 2011年1月《自然》杂志预测的2011年13件重要 发现及事件中包括合成生物学。 二、合成生物学（synthetic biology）的产生 系统生物学 合成生物学发生与发展的学科基础 数 学 物 理 学 工 程 学 生 物 学 计算机科学 化 学 信 息 学 合成生物学 生物能源 生物医药 环境修复 精细 化学品 食品 原料 生物材料 生物传 感器 生物 计算机 应用 2000-2010年合成生物学论文及专利发表情况(Scopus 数据库) 三、合成生物学的研究内容 1、生物大分子的合成与模块化 2、生物基因组的合成、简化与重构 3、合成代谢网络 4、遗传/基因线路的设计与构建 5、细胞群体系统及多细胞系统研究 6、数学模拟和功能预测 1、生物大分子的合成与模块化 标准化生物大分子的研制和开发 蛋白质的工程化改造与模块化 核酸分子的人工合成——DNA的从头合成 2、生物基因组的合成、简化与重构 人工合成生物全基因组 生物基因组的简化与重构：必需基因、最小基因组 ( Gibson, et al. Science, 2010 ) 首个具有人造DNA的活细胞 必需基因 必需基因（essential genes）是指在一定环境条件下，维持某种生物体的生命活动所必不可少的基因。这些基因所编码蛋白质的功能被认为是生命的基础，去除一个必需基因将使生物体无法继续存活。 目前用于必需基因研究的实验方法主要有： 转座子突变技术(transposon mutagenesis)、 RNA干扰技术(RNA interference)和T-DNA插入(T-DNA insertion)。 (/deg/) 真核/原核 已确定 数目 方法 1.拟南芥 2.曲霉属真菌 3.秀丽隐杆线虫 4.斑马鱼 5.黑腹果蝇 6.智人 7.小家鼠 8.酿酒酵母 Arabidopsis thaliana Aspergillus fumigatus Caenorhabditis elegans Danio rerio Drosophila melanogaster Homo sapiens Mus musculus Saccharomyces cerevisiae 356 35 294 288 339 118 2114 1110 T-DNA insertion insertional mutagenesis RNA interference insertional mutagenes