Chapter 6 DNA recombination知识讲稿.ppt

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Chapter 6 DNA recombination;;第一节 同源重组 ;;;二、Holiday重组模型;3、游离端交叉连接,形成Holliday 结构;6、垂直切割导致重组发生 ?;7、水平切割不会导致重组,而产生两段短的杂合链;三、细菌的同源重组;(1)RecA: 促进单链同化或单链吸收?;单链同化发生的三个条件 其中一个DNA必须存在单链区 其中一个DNA必须有一个自由3’末端 此单链区和3’末端必须位于两分子之间互补的区域内;RecA 包裹的ssDNA 入侵双螺旋DNA;(2)RecBCD 复合体 三种酶的活性: 核酸酶;解旋酶;ATPase 作用: 在Chi位点处产生含3’游离未端单链.;Chi位点---RecBCD识别的靶位点 5 GCTGGTGG 3 3 CGACCACC 5 是重组频率较高的部位 E.coli中每隔约5~10 kb有一个拷贝;(3)RuvAB 复合体: 促进分支迁移; ;2、细菌DNA同源重组的过程;(d) RecA帮助入侵单链寻找同源序列. (e) 切割; 单链交换 (f) 连接酶封闭切口, 产生 Holliday 结构;(g) 在RuvA 和RuvB 作用下发生分支迁移. (h) RuvC 使Holliday结构解离;第二节 位点特异性重组;(二)通过位点特异性重组实现两种类型间的转换 λDNA整合到宿主DNA →进入溶源状态 λDNA从宿主DNA 中切离 →进入裂解状态 (三)催化重组的酶 1、整合酶 Int (integrase):类似拓扑异构酶活性 2、整合宿主因子(IHF,integration host factor ) 3、切除酶(excisionase) (四)重组位点: 附着位点(attachment site) attP( POP’)和attB( BOB’)有15bp核心序列配对;(五)重组过程: 整合:POP’ + BOB’ →BOP’—POB’ 切离:BOP’—POB’ → POP’ + BOB’ ;第三节 转座;二、转座子发现: McClintock B: 1938年,提出转座基因概念 1944-1950,阐明“Ds-Ac调控系统” 1983年,获诺贝尔生理医学奖;三、转座子的基本结构特点 1、自身携带有转座酶基因 2、末端有反向重复序列(IR) 3、转座后两端有正向重复序列(DR);四、转座子的类型;ATGCA TACGT 2、Tn (复合转座子, composite transposons) 特点: (1) 2-10kb;; (2)两端有两个相同或高度同源IS序列 (3)含转座酶基因 / 抗???素抗性基因;ISL;3、TnA (TnA family) 特点: (1)5~25kb; (2)两端IR(30~40bp)相似或相同;两端无IS组件; (3)转座酶基因 / 解离酶基因 / 抗生素抗性基因 (4)Res位点:与共整合体的解离有关 ;(二)真核生物转座子;(一)转座相关的酶 1、转座酶: (1)识别转座子的两端序列和受体DNA的靶序列 (2)切割使转座子从供体DNA中释放出来 (3)在靶位点上作出交错的切割(类似限制酶) (4)催化一对转酯反应,使转座子3’端与靶位 点相连 2、解离酶: (1)TnA家族转座必须 (2)催化两个转座子拷贝间的位点特异性重组;;(二)非复制型转座;1、非复制型转座定义 转座子作为一个可移动的单位直接被移位,留下一个断裂的供体位点。 2、非复制型转座过程 (1)转座酶使转座子从供体DNA中释放出来; 转座酶使受体DNA靶位点形成交错切口; (2)转座子插入交错切口(转座酶--转酯反应) , (3)连接并修复缺口单链,受体DNA产生同向重复序列。; (三)复制型转座 1、定义:整个转座子被复制,所移动和转位的仅 仅是原转座子的拷贝。;4;2、复制型转座过程: (1)转座酶使转座子和受体DNA双链形成交错切口; (2)转座子两端形成复制叉,复制、连接补齐缺口, 形成共整合体; (3)重组 (解离酶),拆分共整合体; (4)受体DNA产生同向复序列。 ;

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