[分子生物学实验技术]分子生物学实验技术.docVIP

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  • 2018-04-22 发布于江西
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[分子生物学实验技术]分子生物学实验技术 篇一 : 分子生物学实验技术 DNA分子的限制性内切酶消化 限制性内切酶可特异地结合于一段被称为限制酶识别序列的DNA序列位点上并在此切割双链DNA。的DNA片段。1个单位限制性内切酶是指在最适条件下,在50μl体积1小时内完全切开1μgλ噬菌体DNA所需的酶量。不同的限制性内切酶生产厂家往往推荐使用截然不同的反应条件,甚至对同一种酶也如此。但是,几乎所有的生产厂家都对其生产的酶制剂优化过反应条件,因此购买的内切酶说明书上均有其识别序列和切割位点,同时提供有酶切缓冲液和最适条件,使得酶切反应变得日益简单。 一、限制性内切酶对DNA消化的一般方案 1.限制性内切酶反应一般在灭菌的0.5ml离心管中进行。 2.20μl体积反应体系如下: DNA 0.2-1 μg 10×酶切buffer 2.0 μl 限制性内切酶 1-2 u 加ddH2O 至 20 μl 限制性内切酶最后加入,轻轻混匀,稍加离心,放置于最适温度水浴并按所需的时间温育,一般为37水浴消化1hr。 3.用于回收酶切片段时,反应总体积可达50-200μl,各反应组分需相应增加。 4.多种酶消化时若缓冲液条件相同,可同时加入;否则,先做低温或低盐的酶消化,再做高温或高盐的酶消化。 5.酶切结束时,加入0.5M EDTA使终浓度达10mM,以终止反应。或将反应管在65水浴放置10min以灭活限制性内切酶活性。 6.如消化反应体积过大,电泳时加样孔盛不下,可加以浓缩:终止反应后,加入0.6体积的5M乙酸铵和2倍体积无水乙醇,在冰上放置5min,然后于4离心12000g × 5min。倾去含大部分蛋白质的上清液。于室温晾干DNA沉淀后溶于适量TE中。 7.如要纯化消化后的DNA,可用等体积酚/氯仿和氯仿各抽提一次,再用乙醇沉淀。 二、电泳检测 取质粒酶切产物适量,加适当loading buffer混匀上样,以未经酶切的质粒或/和酶切的空载体作对照,采用 1-5V/cm的电压,使DNA分子从负极向正极移动,至合适位置取出置紫外灯下检测,摄片。 三、注意事项 1. 浓缩的限制性内切酶可在使用前以1×限制酶缓冲液稀释,切勿用水稀释以免酶变性。 2. 购买的限制性内切酶多保存于50%甘油中,于-20是稳定的。进行酶切消化时,将除酶以外的所有反应成分加入后即混匀,再从-20冰箱中取出酶,立即放置于冰上。每次取酶时都应更换一个无菌吸头,以免酶被污染。加酶的操作尽可能快,用完后立即将酶放回-20冰箱。 3.尽量减少反应体积,但要确保酶体积不超过反应总体积的10%,否则酶活性将受到甘油的抑制。 4.通常延长时间可使所需的酶量减少,在切割大量DNA时可用。在消化过程中可取少量反应液进行微量凝胶电泳以检测消化进程。 5.注意星号酶切活力。 DNA片段回收与纯化 质粒、噬菌体等经酶切,电泳;PCR产物经电泳后,常常需要对一些DNA电泳片段进行回收和纯化,用于亚克隆、探针标记等。DNA回收和纯化常用方法有压碎法、低融点琼脂糖法、冻融法等,也有现成的试剂盒供应。 一、冻融法 1. 紫外灯下仔细切下含待回收DNA的胶条,将切下的胶条捣碎,置于1.5ml离心管中; 2. 加入等体积的Tris-HCl饱和酚,振荡混匀; 3. -20放置5-10min; 4. 4离心10000g×5min,上层液转移置另一离心管中; 5. 加入1/4体积H2O于含胶的离心管中,振荡混匀; 6. -20,放置5-10min; 7. 4离心10000g×5min,合并上清液; 8. 用等体积酚/氯仿、氯仿分别抽提一次,取上清; 9. 加入1/10体积3M NaAc、2.5倍体积预冷的无水乙醇,混匀; 10. -20,静置30min; 11. 4离心13000g×10min,弃上清,75%乙醇洗沉淀1-2次,晾干; 12. 加适量H2O或TE溶解沉淀。[] 二、DNA回收试剂盒 1. 紫外灯下仔细切下含待回收DNA的凝胶,置1.5ml离心管中,称重。 2. 加入Buffer QG,置50水浴10min。 3. 若回收片段小于500bp或大于4kb,则需加入异丙醇,混匀。 4. 将小柱放在2ml收集管上,将上述溶液加于柱上。 5. 4离心13000g×1min,弃去收集管中液体。 6. 加入500μl Buffer QG

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