十单元微生物的分类和鉴定1节.pptVIP

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(二)细胞化学成分用作鉴定指标 细胞壁化学成分:如根据肽聚糖分子中肽尾第三位氨 基酸的种类、肽桥的结构以及与邻近肽尾交联的位置 的不同来划分。 全细胞水解液的糖型:对放线菌进行分类 磷酸类脂成分的分析 枝菌酸的分析:对“诺卡氏菌形放线菌”进行分类 醌类的分析:对放线菌鉴定上有一定的价值 气相色谱技术用于微生物鉴定:分析代谢产物中脂肪 酸和醇类等成分,对厌氧菌的鉴定十分有用。 (三)数值分类法 又称统计分类法,是一种依据数值分析的原理,借助现代计算机技术对拟分类的微生物对象按大量表型性状的相似性程度进行统计、归类的方法。现代数值分类学是1957年由英国学者Sneath 在研究细菌分类时提出的。 首先要准备一批待研究的菌株和有关典型菌种的菌株,在比较不同的菌株时,要采用一套共同的可比特征,研究它们在形态、生理、生化、遗传、生态和免疫学方面的特征,所用特征越多,所得结果准确性越高。 (1)计算两菌株间的相关系数 Ssm=a+d/a+c+b+d Sj=a/a+b+c (2)列出相似度矩阵 对所研究的各个菌株都按配对方式计算出它们的相关系数后,把所得数据填入相似矩阵中。 (3)将矩阵图转换成树状图 第十一章 微生物的分类和鉴定 Classification and identification 概 论 地球上到底有多少物种至今仍无准确答案,估计有分类记录的各类物种大约有150万,其中微生物超过10万。微生物学工作者要认识、研究和利用微生物或控制有害微生物,必须对它们进行分类(classification)。 微生物分类学(microbial taxonomy)是一门按微生物的亲缘关系把它们安排成条理清楚的各种分类单元或分类群(taxon)的科学。它的具体任务有:分类、鉴定(identification)和命名(nomenclature)。 第一节 通用分类单元 一、 分类单元及其等级 分类单元(taxon)是指具体的分类群,如原核生物界(Procaryotae)、肠杆菌科(Enterobacteriaceae)、枯草芽胞杆菌(Bacillus subtilis)等都分别代表一个分类单元。微生物的分类单元一般也分为七个基本的分类等级(rank或category)或分类阶元。由上而下依次是:界、门、纲、目、科、属、种。分类单元的等级(阶元)只是分类单元水平的概括,它并不代表具体的分类单元。 种以上的分类单元 Domain(域) Kingdom(界) Phylum(门) Class(纲) Order(目) Family(科) Genus(属) Species(种) 二、 种的概念 种(species)是生物分类中基本的分类单元和分类等级,指一大群表型特征高度相似、亲缘关系极其接近、与同属内其他种有着明显差异的菌株的总称。 在微生物中,一个种只能用该种内的一个典型菌株(type strain)来作具体标本,故这一典型菌株就是该种的模式种(type species)。 新种:是指权威性的分类、鉴定手册中从未记载过的一种新分离并鉴定过的微生物。 三、 学名 学名是指一个菌种的科学名称,它是按照《国际细菌命名法规》命名的、国际学术界公认并通用的正式名字。一个种的学名是用拉丁词或拉丁化的词组组成。 (一)双名法 学名=属名(斜体)+种的加词(斜体) +(首次定名人)+现名定名人+定名年份 例:大肠埃希氏菌(大肠杆菌) Escherichia coli (Migula) Castellani et Chalmers 1919 (二)三名法 当某种微生物是一个亚种(subspecies, 简称subsp)或变种(variety, 简称var,是亚种的同义词)时,学名就应该按三名法拼写: 学名=属名(斜体)+种的加词(斜体) +符号subsp或var(正体) +亚种或变种的加词(斜体) 例1:苏云金芽孢杆菌蜡螟亚种(蜡螟苏云金芽孢杆菌) Bacillus thuringiensis (subsp) galleria 例2:酿酒酵母椭圆变种(椭圆酿酒酵母

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