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生物信息学中途径研究进展-林产化学与工业
生物技术通报
年第 期
·综述与专论· BIOTECHNOLOGY BULLETIN 2008 1
生物信息学中途径研究进展
刘蓉 刘军万
(中南林业科技大学计算机科学学院,长沙 )
410004
摘 要: 叙述了生物信息学中途径的研究背景;综述了近几年来相关途径及生物化学数据库及其特点;介绍了有
关的途径分析方法。同时对于途径研究应用作了展望。
关键词: 生物信息学 代谢途径 信号途径 基因网络 数据库
AdvancesintheResearchofPathwaysinBioinformatics
LiuRong LiuJunwan
( , , )
SchoolofComputerSouthCenterUniversityofForestScienceandTechnologyChangsha410004
: ;
Abstract ThisarticleintroducedtheresearchbackgroundofpathwaysinbioinformaticsSummarizedthedatabases
;
ofcorrelatedpathwaysandbiochemistryandgeneralizedthecharactersDiscussedsomemethodsofpathwaysanalysis.At
,
thesametimemadeprospectoftheinvestigationapplicationsofpathways.
:
Keywords BioinformaticsMetabolicpathwaysSignalpathwaysGenenetworksDatabase
1 生物信息学中途径的发展背景 2 途径数据库的研究状况
伴随着人类基因组计划的启动,生物信息学这 2.1 代谢途径和生物化学数据库
一新兴交叉学科的蓬勃发展,目前已经产生了大量 技术近 年的迅速发展和普及,建立
Internet 20
的以核酸和蛋白质等生物大分子数据库及其相关 了一个极为庞大的广域信息网络系统。这无疑为生
的文献、资料图书。从 1994年开始,《核酸研究》杂 物信息学这一新兴领域的产生和发展奠定了坚实
[1] [2]
志每年第一期是生物数据库专辑 。国际上 大核
3 的基础 。随着实验生物学的迅猛发展,特别是科
苷酸、蛋白质数据库分别是:美国国家生物技术信 学家完成了包括人类自身在内的60种生物的全基
息中心( )的 数据库、欧洲生物信息
NCBI GenBank 因组测序,产生了大量的数据信息。计算机科学家
学研究所( )的核酸序列数据库 和日本信
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