拷贝数变异导致的单基因遗传病.docVIP

单基因遗传病与拷贝数变异的研究进展 李世音1，周浩1，秦海涛1，郭洪2*，白云2 1.第三军医大学学员旅，重庆，400038 2.第三军医大学医学遗传学教研室，重庆，400038 摘要：拷贝数变异(Copy number variation，CNV)是指1kb以上的大片段结构变异，如插入、缺失、倒位、易位等，广泛存在于人类基因组。过去几年中，随着基因组信息的不断挖掘以及检测技术的进步，CNV在遗传病发病中的作用越来越受到重视，其致病机制可能与基因剂量效应、基因断裂、基因融合和位置效应等有关。单基因遗传病的发病基础是一个主效致病变异，是研究变异与疾病关系的天然模型。因此，在单基因遗传病家系中克隆、鉴定致病性CNV对研究其致病机制有着重要意义。本文主要围绕CNV与单基因遗传病的关系进行综述，分析了单基因病中CNV的主要致病机制。对CNV的深入研究，有助于更好的理解基因组变异与疾病之间的关系，对疾病的遗传性致病因素有更新的认识。 关键词：拷贝数变异；单基因遗传病；单核苷酸多态性；基因组结构变异；突变 Progress on pathogenic copy number variations and monogenic disease Li Shiyin1，Zhou Hao1，Qin Haitao1，Guo Hong2*，Bai Yun2 1.Student Brigade，Third military medical universityThird military medical university，Chongqing，400038 Abstract: Copy number variation (CNV) widely exists in the human genome, which denotes large segment DNA structure variation with a magnitude over 1kb,such as insertion，deletion,inversion and translocation. In the past years,along with the advancement of genome-wide datamining and research assays,CNV received more and more attention. The pathogenic menchanism of CNVs might involve gene dosage,gene disruption,gene fusion,and position effects. Monogenic disease is natural model to study the relationship between genetic variation and disease,so it＇s important to clone and identify pathogenic CNV in monogenic disease family. Here we reviewed the relationship between CNV and monogenic disease,and discuss the pathogenic mechanism of CNV. Further studies on CNVs will shed new light on the missing heritability of human diseases and the relationship between genetic variations and disease. Keywords：Copy number variation; Monogenic disease; Single nucleotide polymorphism; Genomic?Structural?Variation; Mutation 拷贝数变异(Copy number variation，CNV)一般是指长度为1kb以上的基因组大片段的拷贝数增加或者减少，主要表现为亚显微水平的缺失、重复和倒位。与SNP相比，CNV数量虽然不多，但涉及更多的基因组序列，突变率更高。CNV是人类遗传多样性和个体间遗传差异的一个重要原因，除了一部分会致病以外也可以作为遗传多态性的一种。2004年，两项里程碑式的研究[1，2]发现这种DNA拷贝数亚微观的变异(500 kb)广泛存在于正常人类基因组中。2006年末，Redon小组[3]和Wong小组[4]相继发布了人类基因组CNV图谱。2011年，Mills等[5]指出人类基因组中每400万个碱基对中平均有100