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- 2018-04-27 发布于河南
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09级复习课
1.注册号为XP_001918319的序列来自于什么生物?是DNA、RNA还是蛋白质?由多少个碱基或氨基酸组成?分子是线形还是环状?GI号多少?
答:Equus caballus (horse) 蛋白质 1730 aa linear
2.想查找植物抗性基因相关的文献,以“resistant gene”为检索词,加引号和不加引号得到的结果是否相同?为什么?两种检索中,Pubmed数据库中满足条件的记录分别为多少条?
答:不同。不加引号时只要两个词都出现即可,可以是分别单独出现;加引号要求两个词以词组形式一起出现。不加引号时,有49108条,加引号时有473条。
3.用Blastn程序进行序列对位排列分析时,是用核酸还是用蛋白质搜索核苷酸数据库?搜索时能不能用原始序列进行搜索?用基因Z83834进行Blastn搜索时,应选用数据库?241985883。
4.两条序列的对位排列(BLAST 2 sequences)能充分发掘两条序列的同源区段,请以U72725为Query Sequence、U37133为Subject Sequence进行对位排列分析,找出同源区段,并绘图。
答:有3个同源区段:
Query 4771-5158 6205-7386 7670-8033 Subject 1-397 1519-2679 3515-3878
如图:
5. 结合生物信息学的知识,
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