分子标记分析印度与.pptVIP

Diversity and genetic differentiation among populations of Indian and Kenyan tea ( Camellia sinensis (L.) O. Kuntze ) revealed by AFLP markers 利用 AFLP 分子標記分析印度與 肯亞茶樹族群的歧異度與遺傳分化 茶樹遺傳種源的收集 Kangra Valley 地區 中國型 阿薩姆型 Kangra Jwala Kangra Asha 結論 在主成分多變量分析座標圖中 從肯亞和印度來的阿薩姆品系 以及中國品系都很靠近在一起 肯亞茶樹起源於印度 結論 廣泛的遺傳變異 中國型在座標圖中的顯示出較分散 相同地理區域收集的材料 低的遺傳變異 總結 AFLP分子標記 快速、重現性高、偵測得基因座數目多 遺傳歧異度的分析 品種鑑定 謝謝大家 * * 書報研讀 作者：S. Paul , F. N. Wachira , W. Powell , R. Waugh 出處：Theor Appl Genet (1997) 94: 255~263 指導老師：王裕文 老師 報告學生：蔡依真 印度 緬甸、中國高棉、日本 印度 其他國家 產生的疑問 那目前肯亞的茶樹族群也是從印度培育的茶樹源起的嗎？ 重要茶樹栽培地區 印度 肯亞 作者基本想法 1995年 1996年 RAPD 分析肯亞茶樹族群 AFLP分析印度與肯亞茶樹族群 茶樹分類 中國型 阿薩姆型 高棉型 小葉灌木 大葉高大樹木 介於中國與阿薩姆型間 非洲 肯亞 印度 高棉 中國 分類產生的問題 以型態、農藝性狀為分類標準 將茶樹族群正確分類是很困難的 分類後的群體可能也無法反映出真實的遺傳相似度 利用分子標記解決 利用生化及分子上的技術來分析這些遺傳上的歧異 常用的有RFLP、RAPD、AFLP等等分子標記分析 利用AFLP分子標記 除了利用AFLP來研究茶樹族群間與族群內的遺傳變異外。我們再次利用AFLP分子標記 來確認茶樹族群的分類 為什麼採用AFLP分析 RFLP 大量高純度 DNA  ＆  放射性 RAPD 實驗條件敏感，重現性低 AFLP 可靠穩定 重現性高 多型性數高 RFLP Restriction Fragment Length Polymorphism 探針尋找 RAPD Random Amplified Polymorphic DNA AFLP Amplified Fragment Length Polymorphism 實驗驗證AFLP 1997年數個歐洲分生實驗室 參與比較的分子標幟包括 RAPD、AFLP與SSR AFLP的重現性最高 AFLP 每次分析可偵測到的基因座數目也較多 植物材料 1. Dhoedham 阿薩姆型2. T-253 中國型3. TV9 阿薩姆型4. Sundaram 阿薩姆型5. P-312 中國型6. Samsingh 中國型7. Kangra Asha (KVK-1) 中國型8. Kangra Jwala (KVK-3) 阿薩姆9. M-6 中國型10. M-18 中國型11. M-51 中國型12. M-93 中國型13. C-33 中國型14. C-37 中國型15. C-124 中國型 由印度茶葉試驗所收集而來 植物材料 由肯亞茶葉研究機構收集來 16. 382/1 阿薩姆 17. D99/10 阿薩姆18. 301/2 高棉型19. 301/3 高棉型20. 6/8 阿薩姆21. 7/9 中國型22. 56/89 中國型23. 4/28 中國型24. 14/1 中國型25. K/Purple 中國型26. SFS 150 阿薩姆27. 430/43 阿薩姆28. BB7 阿薩姆29. BB21 阿薩姆30. BB35 阿薩姆31. TN 14/3 中國型32. 471/15 阿薩姆 實驗步驟 萃取參試茶樹葉片之DNA 用EcoRI、MseI 兩種限制脢切割DNA 兩端各黏接EcoRI、MseI轉接子 利用與轉接子互補的引子進行前增殖 實驗步驟 與EcoRI轉接子端相容的引子末端標定 用EcoRI＋3、MseI＋3引子進行選擇性PCR增殖 膠體電泳 以 X 光底片曝光