植物启动子加值分析与基因调控网路之建构成果报告成大新进教师.PDFVIP

植物啟動子加值分析與基因調控網路之建構成果報告 (成大新進教師學術研究計畫 ) 一、研究目的 本研究計畫之主要目的是建立完整的阿拉伯芥基因轉錄調控分析平台，然而 我們不只是建立轉錄因子與啟動子之間的關係，同時結合高通量的實驗數據、基 因群分析、 Gene Ontology 分析、跨物種保留區域(conserved regions)分析，除提 高 TFBSs 預測的準確度，也能更忠實地呈現植物在生長發育或抵抗逆境之基因轉 錄調控情形，以及建立特殊啟動子資料庫。另一方面，基因調控網路中，我們也 將結合miRNA 與其標的基因和標的轉錄因子(transcription factor, TF) 、TF-TF 、TF- 其他蛋白質之關係、轉錄因子PTM (post-translation modification資訊，使阿拉伯) 芥基因調控網路更臻完善。 研究 之主要目的 ： (1)建立完整的植物轉錄因子資料庫，儲存目前所有經由實驗證實來自所有植 物的轉錄因子及其轉錄因子結合序列； (2)建立植物完整的已知與預測啟動子序列資料庫； (3)分析啟動子上轉錄因子結合位置，找出轉錄因子與標的基因之間的關係； (4)透過