代表性英文论文中文摘要.PDF

代表性英文论文中文摘要 1. Cryptic prophages as targets for drug development Drug Resistance Updates 2016 （IF 9.1 ） 噬菌体DNA 占细菌基因组比例可高达20% ，这些DNA 可编码从光合作用 到自身免疫相关的多种蛋白。因此，噬菌体极大的促进了病原菌的代谢潜能。活 跃的原噬菌体携带的基因编码毒力因子和抗生素抗性因子，它可通过 SOS 应急 反应从基因组切离并形成可传播的活跃噬菌体，隐匿型原噬菌体是溶源型噬菌体 整合在细菌基因组中突变的产物，它们可以从基因组中切离但不能裂解宿主。因 此，隐匿型原噬菌体是相对永久的基因库，我们开始关注这些基因如何为宿主致 病提供帮助。我们对活跃型原噬菌体和隐匿型原噬菌体来源的蛋白在细菌毒力、 抗生素抗性和抗生素耐受方面的功能进行了探索，原噬菌体上经常携带的毒素- 抗毒素系统中的毒素的激活可介导形成非遗传的休眠细菌进而使细胞对抗生素 耐受。因此，隐匿性原噬菌体是非常具有药物开发前景的靶点。 2. Cold adaptation regulated by cryptic prophage excision in Shewanella oneidensis The ISME Journal 2016 （IF 9.3 ） 温度是细菌所能感知的最重要的环境因子之一。本研究中，我们发现了一种 崭新的细菌冷适应机制，该机制发生在 DNA 水平，由隐蔽性原噬菌体从细菌 Shewanella oneidensis 基因组上自发切离而介导。前期对细菌低温耐受的机制研 究研究主要集中在细菌细胞膜结构的变化和细胞内 RNA 和蛋白质水平的变化， 而基因组的变化是否参与低温耐受并不清楚。我们采用全基因组深度测序的方法 来检测冷适应细菌DNA 位点的变化。发现随着温度降低，一个新颖的P4 类原 噬菌体的切离率提高了 10,000 倍。更为重要的是，尽管该原噬菌体切离的细胞 所占整个群体细胞的比例并不高，但却可以促进群体产生更多生物被膜，并且可 使整个群体在低温下存活更久。该原噬菌体的切离通过失活一个关键基因 tmRNA 进而影响细胞的生理功能。进一步发现细菌编码的类组蛋白 H-NS 可以 结合该原噬菌体的切离酶的启动子区而完全抑制该原噬菌体的切离。在低温条件 下H-NS 的表达量下调，这导致低温下原噬菌体的切离率升高。一言概之，我们 的研究结果发现隐蔽性原噬菌体的切离可以作为一个调控开关，通过控制 tmRNA 和生物被膜的生成，使宿主在低温下更久的存活。 3. RalR (a DNase) and RalA (a small RNA) form a type I toxin–antitoxin system in Escherichia coli Nucleic Acids Research 2014 （IF 9.1 ） 毒素-抗毒素系统中未发现可切割DNA 的蛋白。我们发现隐匿性原噬菌体rac 中的RalR 和RalA 组成I 型毒素-抗毒素系统，在该系统中，抗毒素RalA 为非编 码RNA ，通过16 bp 的碱基互补序列结合于毒素RalR 的mRNA 区域。毒素RalR 非特异性切割甲基化和非甲基化的DNA 。RNA 分子伴侣Hfq 对抗毒素RalA 的 稳定性至关重要。此外，该毒素-抗毒素系统增强细胞对磷霉素的抗性。所以， 我们发现隐匿性原噬菌体的基因整合到宿主基因组上功能会发生多样性分化。 4. Type II toxin-antitoxin MqsR/MqsA controls type V toxin/antitoxin GhoT/GhoS. Environmental Microbiology Environmental Microbiology 2013 （IF 6.2 ） 在毒素-抗毒素系统中，部分毒素具有核糖核酸内切酶活性，通过选择性降 解mRNA 来调控蛋白质的表达，但是毒素调控其他毒素-抗毒素系统还未见报道。 GhoT 是一种五型毒素-抗毒素系统GhoST 中的膜毒素，能够引起细胞变成“鬼细 胞”，抗毒素GhoS 能够特异性的降解GhoT mRNA 。本文通过体内和体外实验证 实，由于ghoT mRNA 中不含有MqsR 的5„-GCU