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- 2018-05-11 发布于河南
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实验三.系统发育分析软件的使用 分子系统发育分析 系统发育分析研究是研究物种进化和系统分类的一种方法,研究对象为携带遗传信息的生物大分子序列,采用特定的数理统计算法来计算生物间的进化关系。并用系统进化树,即一种类似树枝状得图形来概括生物间的这种亲缘关系。 系统发育树构建的相关软件 ClustalX (序列比对软件) ModeltestMrModeltest(碱基替换模型筛选软件) PHYLIP MEGA PHYML PAUP BEAST Figtree (树形显示软件) TreeView (树形显示软件) 实例讲解_MEGA软件构建系统进化树 MEGA (Molecular Evolutionary Genetics Analysis) 该软件是由Kumar等编写的进行分子进化遗传分析的免费软件包,能对DNA、mRNA、氨基酸序列及遗传距离进行系统发生分析。在建树方法上,提供了目前最常用的UPGMA,ML,NJ及MP法,对所获得树也可进自举值检验及标准误估计可靠性检验。 优点为:简单易用 最新版本下载/地址为:http:/ 将抽样过得序列转换 DNADIST * 分子系统发育分析 系统发育进化树( Phylogenetic tree) 用一种类似树状分支的图形来概括各种生物之间的亲缘关系。 系统进化树的主要构成
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