实验六-系统发育分析-Phylip-生物信息学.docVIP

实 系统发育分析－Phylip/phylip.html 实习内容： （一）序列的前期准备 （二）最大简约法建树（Maximum Parsimony） （三）最大似然法建树(Maximum Likelihood ) （四）距离法建树(Distance Method) 作业： 任意选取五个以上物种的同源核酸或/和蛋白质序列,分别采用最大简约法，最大似然法和距离法 构建进化树，给出简洁的步骤和必要的图示，并分析这三种方法的差别。 答：五种核酸序列： Rattus norvegicus giref|NM_033234.1| Rattus norvegicus hemoglobin, beta (Hbb), mRNA Mus musculus gi|218749876|ref|NM_008220.4| Mus musculus hemoglobin, beta adult major chain (H bb-b1), mRNA Bos taurus gi|160358323|ref|NM_173917.2| Bos taurus hemoglobin, beta (HBB), mRNA Homo sapiens giref|NM_000518.4| Homo sapiens hemoglobin, beta (HBB), mRNA Sus scrof