第4章PubMed数据库检索091207.pptVIP

PubMed数据库检索 王 敏 wangmin@ 中国医学科学院 医学信息研究所 讲课要求 理解PubMed数据库收录的时间范围和学科范畴； 掌握Mesh主题词检索； 掌握PubMed数据库提供的主要功能； 掌握PubMed提供的全文链接功能以及与其它资源的链接； PubMed 目录 1 PubMed数据库介绍 2 PubMed主要功能 3 PubMed辅助功能 4 临床查询 5 检索结果输出 6 获取原文及相关资源 National Center for Biotechnology Information Entrez System Entrez cross-database search 1.1 PubMed页面介绍 总览 数据库栏 检索框 特征栏 左侧导航栏 1.2PubMed数据库的主要组成 包括五部分： Medline（最主要的组成部分） 出版商提供的数据(PubMed - as supplied by publisher) 加工中的数据 (PubMed - in process) OLDMEDLINE PubMed PubMed文献题录标注 MEDLINE：[PubMed - indexed for MEDLINE] 出版商提供的数据：[PubMed - as supplied by publisher] 加工中的数据：[PubMed - in process] OLDMEDLINE：[PubMed - OLDMEDLINE] PubMed：[PubMed] PubMed - indexed for MEDLINE PubMed - as supplied by publisher PubMed - in process PubMed - OLDMEDLINE 2 PubMed主要功能 简单检索（快速检索） 高级检索（组配/限定） 主题词检索（MeSH Database） 期刊检索(Journal Database) 论文检索(Single Citation Matcher/Batch Citation Matcher) 特色功能：自动语词转换功能 （Automatic Term Mapping,ATM） 检索规则 主题词检索（MeSH） 支持布尔逻辑检索（AND，OR和NOT） 支持截词检索（用*，如infect*） 支持词组检索（用双引号“”，如“Vitamin k”） 支持限定检索：采用“检索词[字段标识符]”形式 PubMed提供的字段标识符 2.1 简单检索 2.2 高级检索 (组配/限定) Limits 作者 期刊 时间（入库时间/出版时间） 全文 语种 文献类型 … 限定 索引/组配 2007-2009年在Nature上发表的有关IPS（ Induced pluripotent stem cells ）的免费全文文献 2.3 主题词检索 2.3 主题词检索 主题词也称为叙词，是对自然语言进行规范化处理后的结果。 PubMed数据库的主题词表 （Medical Subject Headings,MeSH） 主题词(Headings) 主要主题词(MeSH Major Topic)描述文献重点讨论的内容 次要主题词(MeSH)描述文献一般涉及的问题 副主题词(Subheadings) /mesh/MBrowser.html 主题词检索的优点 提高查准率 提高查全率 主题词“心血管疾病” 主题词检索的不足 只能检索Medline数据（有主题词标引的数据） 不能检索 出版商提供的数据：[PubMed - as supplied by publisher] 加工中的数据：[PubMed - in process] OLDMEDLINE：[ PubMed - OLDMEDLINE] PubMed ：[PubMed] 并不是所有的词都有主题词 Influenza A Virus, H5N1 A subtype of INFLUENZA A VIRUS comprised of the surface proteins hemagglutinin 5 and neuraminidase 1. The H5N1 subtype, frequently referred to as the bird flu virus, is endemic in wild birds and very contagious among both domestic (POULTRY) and wild birds. It does not usually infect humans, but some cases have been reported Year introdu