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- 2018-05-16 发布于四川
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(1) R(H2O2+O) → a2 → a2/P1 → P1(H2O+O2) (2) R(H2O2+O) → R/a4 → a4 → a4/P2 → P2(OH+HO2) (3) R(H2O2+O) → R/a3 → a3 → a3/P2 → P2(OH+HO2) 势能面剖面图 四、结论 本章所有计算均利用Gaussian 03程序在计算机上模拟完成。通过使用密度泛函中的B3LYP方法和B3LYP/6-311G(d,p)单点能量校正,给出了反应H2O2+O的势能面剖面图(PES),计算得到了两种产物的三条反应路径,并对其反应机理进行了研究。研究结果表明,在H2O2+O的反应中,得到两种种产物P1(H2O+O2)和P2(OH+HO2)。其中,产物P2更容易生成,有两条路径生成产物P2,分别是路径(2)和路径(3),路径(3)是主要通道;产物P1(H2O+O2)相对较难生成,路径(1)生成产物P1(H2O+O2),反应需要较大能量,不易实现,为次要通道。 * * 05级食品质量与安全专业: 邵薇璇 指 导 老 师 : 牛效迪 报告内容 一、研究背景 二、研究方法 三、实验内容与结果分析 四、结论 一、研究背景 氧自由基的形成 形成方式有三种: 1.共价键的均裂 2.单电子丢失 3.单电子获得 二、研究方法 本次实验主要利用量子化学方法研究整体系的反应,通过寻找反应中间体及过渡态的详细结构,了解中间产物的热力学及动力学稳定性,得到不同反应路径,分析得出反应机理。 具体操作是采用计算机理论模拟计算的方式,推导出反应物、产物、中间体、过渡态的构型,并对其几何构型进行优化,同时通过对相关能量的计算,得出反应势能面的剖面图,从而得出反应路径及相互关系,从而揭示整个反应机理。 实验中主要的软件 Gaussian 03 Gaussian view Chemical office origin 实验步骤 三、实验内容与结果分析 绘制势能面剖面图 优化反应物 优化中间体 优化过渡态 确定反应路径 1.优化反应物 首先利用画图软件GaussView3.7,构建反应物的分子构型,设置键长和键角的值。 然后打开计算软件Gaussian 03,根据实验中使用的密度泛函方法和基组水平设置运行命令,点击运行对反应物进行优化,并保存结果。最后打开out结果文件,读取优化后的反应物几何构型的键长、键角,用ChemOffice画图软件画出详细平面构型。 密度泛函方法和基组水平设置 键长 键角 二面角 运行 错误 正常结果 反应物的构型图 图中H2O2中O—O键长为1.453埃 。总能量E= -225.8 hartree 。hartree是原子单位制中的能量单位,1hartree就是基态氢原子的势能的绝对值,1hartree=27.2114eV=627.5094kcal/mol/NA 二面角120.3° HO2 O2 OH H2O 生成物的构型图 P1 P2 2.优化中间体 首先根据反应物的构型,使用GaussView3.7构建可能形成的中间体。然后使用计算软件Gaussian 03进行模拟运算优化,最后打开Gaussian 03运行的结果文件,读取中间体几何构型的键长、键角,用ChemOffice5.0画图软件画出详细平面构型。 中间体几何构型 a4 a3 a2 a5 a1 a6 3.优化过渡态 确定过渡态构型。过渡态构型的确定是在中间体构型的基础上改变的,即每一个中间体都会有一个或者多个对应的过渡态。所以,首先打开运行正确的中间体构型图,设定中间体可能发生的构型变化。 模拟计算,优化过渡态。打开计算软件Gaussian 03,将步骤1中保存的过渡态构型打开,设置运行命令,点击运行,保存优化结果,文件格式与反应物中间体相同。 打开out结果文件,读取过渡态几何构型的键长、键角,用ChemOffice5.0画图软件画出详细平面构型。 过渡态几何构型图 R/a3 a2/p1 a3/P2 R/a4 a4/P2 4.确定反应路径 确定过渡态前面的中间体。将优化过渡态时形成的所有.chk文件复制到一个文件夹里,注明为forward-chk文件,采用前面优化反应物时的密度泛函B3LYP方法和6-311G(d,p)基组水平,编辑运行命令b3lyp/6-311g(d,p) irc(forward,rcfc,internal),点击运行,并保存运行结果。 确定过渡态后面的中间体。将原始的chk文件复制到一个新的文件夹里,注明为reward-chk文件,与步骤1方法类似,但是运行命令有一点小的变化,应将forward改为reward,即b
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