第八章 微生物分类和鉴定修改-.pptVIP

第八章 微生物的分类与鉴定 第八章 微生物的类与鉴定 一、生物分类学的发展概况 二、三域学说及其发展 图8-1 生物界级的学说发展（阴影部分表示微生物） 第八章 微生物的类与鉴定 一、微生物的分类与命名法则 二、微生物的分类系统 揭示微生物的多样性及其亲缘关系，建立自然分类系统。 第八章 微生物的分类与鉴定 第三节 微生物分类鉴定的方法 第三节 微生物分类鉴定的方法 一、经典分类鉴定方法 二、现代分类鉴定方法 微生物的鉴定方法 细胞的形态和习性水平 细胞组分水平 蛋白质水平 核酸水平 经典 现代 一、经典分类鉴定方法 鉴定步骤： 获得该微生物的纯培养物 测定一系列必要的鉴定指标 查找权威性的菌种鉴定手册 经典分类鉴定中，分类鉴定的依据(鉴定指标)： 1、形态学特征 2、生理生化特征 3、生态学特征 4、血清学反应 5、噬菌体分型(宿主对噬菌体的敏感性分型) 第三节 微生物分类鉴定的方法 一、经典分类鉴定方法 个体形态特征： 细菌细胞的大小、形状、排列方 式、分枝、有无鞭毛、芽孢和荚 膜及其形状和着 生位置、染色反 应等方面。 群体形态特征： 在固体培养基上的菌落形态和在 液体培养基中的生长情况等。 第三节 微生物分类鉴定的方法 1、形态学特征 一、经典分类鉴定方法 2、生理生化特征 （1）营养特征 碳源、氮源和能源的利用能力不同。 （2）代谢产物 根据各种特征性的代谢产物鉴别菌种。 （3）酶活性 淀粉水解、油脂水解、酪素水解、明胶液化 （4）在牛乳培养基中生长的反应 牛乳中是凝固还是胨化，是产酸还是产碱。 第三节 微生物分类鉴定的方法 * * 第一节 微生物在生物界的地位 第二节 微生物的分类与命名 第三节 微生物分类鉴定的方法 第一节 微生物在生物界的地位 第一节 微生物在生物界的地位 一、生物分类学的发展概况 植物界 动物界 原生生物界 真菌界 原核生物界 真细菌界 古细菌界 细菌域 古生菌域 真核生物域 病毒界？ 20世纪70年代以前，生物类群间的亲缘关系 判断的主要根据： 形态结构——形体微小、结构简单 生理生化——缺少有性繁殖过程 行为习性，等等 少量的化石资料——化石资料凤毛麟角 表型特征： 第一节 微生物在生物界的地位 二、三域学说及其发展 b）形态特征在不同类群中进化速度差异很大，仅 根据形态推断进化关系往往不准确； 根据形态学特征推断微生物之间的亲缘关系的缺点： a）由于微生物可利用的形态特征少，很难把所有 生物放在同一水平上进行比较； 虽然根据少量表型特征来推测各类微生物的亲缘 关系而提出的许多分类系统，都随着时间的推移 而不断地被否定了。 第一节 微生物在生物界的地位 20世纪70年代以后，分析和比较生物大分子的结构特征，特别是蛋白质、RNA和DNA这些反映生物基因组特征的分子序列，作为判断各类微生物乃至所有生物进化关系的主要指征。 分子计时器(molecular chronometers) 进化钟(evolutionary clock) 二、三域学说及其发展 第一节 微生物在生物界的地位 蛋白质、RNA和DNA序列进化变化的显著特点是进化 速率相对恒定，也就是说，分子序列进化的改变量 (氨基酸或核苷酸替换数或替换百分率)与分子进化 的时间成正比。 生物大分子为什么可以作为进化标尺依据？ a)在两群生物中，如果同一种分子的序列差异很大时， ------------进化距离远，进化过程中很早就分支了。 b)如果两群生物同一来源的大分子的序列基本相同， ------------处在同一进化水平上。 第一节 微生物在生物界的地位 作为进化标尺的生物大分子的选择原则 1）在所需研究的种群范围内，它必须是普遍存在的。 2）在所有物种中该分子的功能是相同的。 3）为了鉴定大分子序列的同源位置或同源区，要求所 选择的分子序列必须能严格线性排列，以便进行进 一步的分析比较。 4）分子上序列的改变（突变）频率应与进化的测量尺 度相适应。 大量的资料表明：功能重要的大分子、或者大分子中功能重要 的区域，比功能不重要的分子或分子区域进化变化速度低。 第一节 微生物在生物界的地位 RNA作为进化的指征的优点： 16S rRNA被公认为是一把好的谱系分析的“分子尺” 1）rRNA具有重要且恒